聲明:因為本人使用過程中遇到了很多原來人碰得到的問題,放防止以后遺忘,所以做一下記錄,因為前總結(jié)的很到位,所以直接引用到自己日常記錄,供日后查閱。 主要引用為:【原創(chuàng)文章】辣...
聲明:因為本人使用過程中遇到了很多原來人碰得到的問題,放防止以后遺忘,所以做一下記錄,因為前總結(jié)的很到位,所以直接引用到自己日常記錄,供日后查閱。 主要引用為:【原創(chuàng)文章】辣...
寫在前面 進行這部分重復(fù)序列提取和注釋,主要是為了屏蔽基因組的重復(fù)序列,以保證后面基因結(jié)構(gòu)注釋的準確性。大致的流程如下:1.首先使用RepeatModler對組裝好的基因組進...
monocle2在解決細胞軌跡排布結(jié)果可讀性上確實讓人歡喜,但monocle2有個致命的確定,就是分析的細胞數(shù)目有限,最近在分析一個65000多個細胞時的數(shù)據(jù)量時,在orde...
單細胞系列教程目錄索引,持續(xù)更新...[http://www.itdecent.cn/p/98fc6c80c216] 為避免造成環(huán)境污染,建議使用conda創(chuàng)建隔離環(huán)境進行...
轉(zhuǎn)載自https://mp.weixin.qq.com/s/1IM6KSCGIq0cUJhKKXVcIw 背景 選擇清除分析是常用于鑒定群體基因組水平受選擇區(qū)域的一種方法,其...
GetOrganelle是中國科學(xué)院昆明植物研究所金建軍和郁文彬兩位老師共同開發(fā)的質(zhì)體組裝軟件,論文發(fā)表在Genome Biology[https://genomebiolo...
SURVIVOR 是一套用于模擬/評估 SV、合并和比較樣本內(nèi)及樣本間 SV 的工具集,其還可對SV進行重新格式化及進行統(tǒng)計總結(jié),其他詳細信息也可參考工具的wiki。 安裝 ...
SURVIVOR 軟件的功能: 1)Simulate SVs and evaluate existing callers.2) Merge and compare SVs w...
不同的結(jié)構(gòu)變異(structural variation,SV)鑒定工具鑒定出的VCF結(jié)果文件格式不盡相同,但也不是完全沒有規(guī)律可循,主要的格式就有兩種,分別是: BND n...