情況一：在R語言中，我們可以通過函數(shù)na.omit()移除所有含有缺失值的觀測。假如我們有一個數(shù)據(jù)框df,df <- data.frame(A = c(1, 2, NA, 4...
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R語言 對NA值的處理
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R語言 gsub函數(shù)
在R語言中，gsub()函數(shù)用于替換字符串中的指定模式（正則表達(dá)式）為新的字符串。其語法如下： 參數(shù)說明： pattern: 要匹配和替換的正則表達(dá)式模式。 replacem...
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R語言%in% 運(yùn)算符
%in% 運(yùn)算符是R語言中用于測試一個向量中的元素是否包含在另一個向量中的常用運(yùn)算符。它返回一個邏輯向量，其中每個元素對應(yīng)于測試向量中的元素是否存在于目標(biāo)向量中。 具體語法如...
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R語言的子集操作符
R語言中的子集操作符主要是 [ ] 和 [[ ]]，它們用于從數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)中選擇特定的元素或子集。這兩個操作符在向量、列表、數(shù)據(jù)框等數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)上都有不同的用法。 [ ] 子集操作符...
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R語言管道符%>%
在R語言中，%>% 是管道操作符（pipe operator），它通常用于簡化數(shù)據(jù)分析和數(shù)據(jù)處理的代碼，尤其是在使用dplyr包和magrittr包時。%>% 允許你將一個函...
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R語言 list()函數(shù)
在R語言中，list()函數(shù)用于創(chuàng)建一個列表對象。列表是一個存儲不同類型的元素的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，包括數(shù)字、字符、邏輯和復(fù)數(shù)等。下面是使用list()函數(shù)創(chuàng)建一個列表的示例：Rmy_...
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RNA-protein 相互作用數(shù)據(jù)庫-catRAPID今天給大家分享的是如何使用catRAPID數(shù)據(jù)庫來進(jìn)行RNA-蛋白的相互作用預(yù)測。數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址：http://s.tartaglialab.com/page/catrapid_...
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小白學(xué)習(xí)R語言會遇到的問題（持續(xù)更新）
1，為什么讀取數(shù)據(jù)時要加上options(stringsAsFactors = F) ，否則總報(bào)錯？R語言是不太喜歡因子（factor）這類數(shù)據(jù)的，用的多的多半是向量，矩陣，...
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R語言 grep函數(shù)
grep函數(shù)全稱是“global search regular expression and print out the line”，是一種文本搜索工具，可以通過正則表達(dá)式搜...
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R語言 text函數(shù)
一 函數(shù)用途R語言中，text（）函數(shù)同abline（）函數(shù)，lines（）函數(shù)一樣，都是在已有繪圖中添加相關(guān)圖形。text（）函數(shù)的作用是在給定的x和y坐標(biāo)的位置添加字符串...
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R語言 type參數(shù)
type參數(shù)用來控制所生成散點(diǎn)圖的類型，有如下幾個選項(xiàng)： type=“p”表示繪制單獨(dú)的點(diǎn) type=“l(fā)”表示繪制點(diǎn)連成的折線 type=“b”表示有線連接的點(diǎn) type=...
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R語言 符號函數(shù)sign
sign又叫sgn，意思是符號。[符號函數(shù)]（一般用sign(x)表示）是很有用的一類函數(shù)，能夠幫助我們在幾何畫板中實(shí)現(xiàn)一些直接實(shí)現(xiàn)有困難的構(gòu)造。 符號函數(shù) 能夠把[函數(shù)]的...
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絕對中位差（median absolute deviation）
絕對中位差的計(jì)算方法：用原數(shù)據(jù)減去中位數(shù)取絕對值得到新數(shù)據(jù)，新數(shù)據(jù)的中位數(shù)即為絕對中位差。絕對中位差越大，表明數(shù)據(jù)的變化幅度越大。但絕對中位差常用來估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)差，估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)差=1...
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mRNA的提取分離
以NEB Magnetic mRNA Isolation Kit 為例，講解從total RNA中分離mRNA的具體步驟。 一.試劑配制 Lysis/Binding Buff...
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WGCNA分析-軟閾值的挑選1.邊的理解：WGCNA分析全稱是加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析，而在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中兩個重要的概念就是點(diǎn)和邊。點(diǎn)代表基因，邊代表基因表達(dá)相關(guān)性。 2.關(guān)于軟閾值的理解：①計(jì)算共表達(dá)有...
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WGCNA-基本概念基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)一.基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖再將軟閾值挑選之前，我們先介紹一下基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。 在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖中，節(jié)點(diǎn)代表不同的基因，使用節(jié)點(diǎn)間的連線來代表基因間的調(diào)控關(guān)系。 從調(diào)控關(guān)系圖的最基本元素...
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生信技能樹新葉講師<br>這里是新葉的分身馬甲：信你個鬼<br>B站：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fspace.bilibili.com%2F2356770" target="_blank">https://space.bilibili.com/2356770</a><br>歡迎學(xué)習(xí)交流
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技能樹直播課程學(xué)習(xí)-WGCNA-1-數(shù)據(jù)清洗1. 層次聚類 在讀入表達(dá)矩陣，進(jìn)行基礎(chǔ)的篩選，并使用 goodSamplesGenes() 確保沒有太多的缺失值后，我們對樣本進(jìn)行聚類，以剔除離群樣本 可以看到這次的 31...
