發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
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公眾號(hào)：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組、腫瘤免疫、單細(xì)胞組學(xué)
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WB實(shí)驗(yàn)問題總結(jié)（Western blot蛋白質(zhì)印跡）
1.為什么我的細(xì)胞提取液中沒有目標(biāo)蛋白？ 答：原因有很多： a) 你的細(xì)胞中不表達(dá)這種蛋白質(zhì)，換一種細(xì)胞； b) 你的細(xì)胞中的蛋白質(zhì)被降解掉了，你必需加入PMSF，抑制蛋白酶...
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基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控
順式作用原件： DNA序列，位于基因序列的上游或下游，不編碼蛋白，僅提供作用位點(diǎn) 「啟動(dòng)子，增強(qiáng)子，調(diào)控序列」 反式作用原件： 調(diào)控基因表達(dá)的蛋白質(zhì)分子 「GTF，TF，ac...
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組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶SETD2 - MedChemExpress
近日，中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所秦駿課題組與陸軍軍醫(yī)大學(xué)大坪醫(yī)院江軍主任、南京醫(yī)科大學(xué)王曉明教授的合作在Cancer Cell在線發(fā)表了題為 “SETD2 Restric...
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如何通過CHIP-seq分析鑒別基因啟動(dòng)子和增強(qiáng)子
一、表觀遺傳學(xué)的組蛋白修飾 染色體一個(gè)核小體由兩個(gè)H2A，兩個(gè)H2B，兩個(gè)H3，兩個(gè)H4組成的組蛋白八聚體和147bp纏繞在外面的DNA組成。組蛋白有很多修飾形式，包括組蛋白...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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ChIP-seq實(shí)踐（非轉(zhuǎn)錄因子，非組蛋白）在實(shí)戰(zhàn)之前，首先對(duì)CHIP-seq分析做一些了解，以下是從各個(gè)地方copy過來(lái)綜合起來(lái)的，有些散亂，是我認(rèn)為重要以及應(yīng)該了解的知識(shí)點(diǎn)。chip-seq 實(shí)戰(zhàn)就跟在轉(zhuǎn)錄組和外顯...
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使用deeptools生成ChIP-seq信號(hào)熱圖與譜圖整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析時(shí)用到的工具。本文只對(duì)使用的工具用法進(jìn)行簡(jiǎn)單介紹。 deeptools 提供了computeMatrix命令以計(jì)算特定基因組...
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生信技能樹，生信菜鳥團(tuán)，jimmy
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記錄學(xué)習(xí)生信的點(diǎn)滴
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來(lái)的流程 ?? ?? ??
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您好，歡迎訂閱“科研貓”！<br>致敬科研工作者，貓一樣的精靈們！<br>細(xì)致敏銳地“捕捉”科研思路；<br>“飛檐走壁”于各種崎嶇困境；<br>文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)大海里的“捕魚能手”；<br>實(shí)驗(yàn)室里孤獨(dú)的“夜行俠”和“潔癖精”；<br>本號(hào)，旨在營(yíng)造活躍的生物醫(yī)學(xué)科研交流平臺(tái)，歡迎您的加入。
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生信學(xué)習(xí)筆記、腳本編程、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析 ～～～ 生物信息領(lǐng)域的大雜燴～ 好大一鍋亂燉，快到我的額碗里來(lái)～ 好好學(xué)習(xí)，天天學(xué)生信～
