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  • 請問SNP數(shù)據(jù)怎么計算其遺傳距離呢,如Nei,Roger等

    群體遺傳學(xué)之個體間遺傳距離及其計算方法

    01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...

  • PCA需要對snp進行LD過濾嗎?

    主成分分析

    數(shù)據(jù)過濾質(zhì)控之后 PCA分析(gcta) 利用R繪圖

  • 所有的分析都需要對snp進行LD過濾嗎?還是只有PCA不需要?

    2021.11.19 | 群體遺傳結(jié)構(gòu)、PCA、進化樹

    常見的群體結(jié)構(gòu)的分析方法有admixture分析、系統(tǒng)發(fā)生數(shù)分析以及主成分分析等。 1、admixture分析 1)R語言繪圖 admixture的可視化分為兩種 2)pon...

  • 我想問的是文章里的perl .sh腳本可以分享在哪獲取嗎??

    9.2 GWAS:關(guān)聯(lián)分析——TASSEL(GLM/MLM/CMLM)

    TASSEL是最早出現(xiàn)的用于動植物關(guān)聯(lián)分析的軟件,還可以對進化模式以及連鎖不平衡進行評估,功能非常強大,要說缺點,可能就是真的有點慢。 表型數(shù)據(jù)處理在下面這篇帖子中有介紹,這...

  • 腳本可以分享嗎

    9.2 GWAS:關(guān)聯(lián)分析——TASSEL(GLM/MLM/CMLM)

    TASSEL是最早出現(xiàn)的用于動植物關(guān)聯(lián)分析的軟件,還可以對進化模式以及連鎖不平衡進行評估,功能非常強大,要說缺點,可能就是真的有點慢。 表型數(shù)據(jù)處理在下面這篇帖子中有介紹,這...

  • 又一大佬飛升而去,我輩望塵莫及??!

    停更

    本想注銷賬號,后來隨便翻了翻,還是沒舍得。簡書曾讓我投入了很多感情,碼文章也占用了我很多時間,就像自己養(yǎng)大的花一樣,不是隨便就能掐死的。停更大概一年了,主要原因是認(rèn)識到自己有...

  • Python小試牛刀之爬取本地城市新房價格和地址

    利用xpath解析數(shù)據(jù),requests庫爬取房價,大致步驟如下: 獲得目標(biāo)網(wǎng)址,并觀察網(wǎng)址源碼; UA偽裝,請求并獲得響應(yīng); 解析標(biāo)簽數(shù)據(jù); 循環(huán)遍歷提取解析到的數(shù)據(jù),并保...

  • 大佬這個shinyapp怎么打包成本地應(yīng)用的?

    Qplottools分析畫圖工具(本地版)

    以前一直在維護一些R寫的畫圖工具(www.qplot.cn),由于服務(wù)器的配置原因 ,訪問速度很慢,上傳大點的數(shù)據(jù)可能就會斷線,用的人也不是很多,計劃2020.7月服務(wù)器到期...

個人介紹
R語言小白一枚,遺傳育種專業(yè),不定期更新學(xué)習(xí)筆記。
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