Computational Biologist
發(fā)簡信
IP屬地：甘肅
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collect2: error: ld returned 1 exit status maKe: ***[Makefile:30: bwa] 錯誤 1根據(jù)這個教程，在make這步報錯，先是utils.c:33:10: fatal error: zlib.h: 沒有那個文件或目錄可以apt install gcc解決，再次m...
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jupyter運行一直[*]運行不出結(jié)果突然就這樣了，并且kernel error或者連不上 重裝內(nèi)核會報： 按照網(wǎng)上的方式修改kernel.json里的路徑不行 然后發(fā)現(xiàn)python默認版本變成了2.7，查看虛擬...
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批量運行弦圖，封裝函數(shù)一共30個樣本，要出弦圖，先在jupyter里批量運行了PlotFancyVJUsage： 之前是在產(chǎn)生的錯誤文件（vj_pairing_plot.r）之里修改內(nèi)容后一個個樣...
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2022-11-18 安裝tensorflow.ProtocolError: ("Connection broken: ConnectionResetError(10054, '遠程主機強迫關(guān)閉了一個現(xiàn)有的連接。', N...
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安裝SeuratData的解決辦法
想要LoadData("ifnb")需要library(SeuratData)，但是devtools::install_github('satijalab/seurat-da...
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2022-10-09 ?；鶊D
得到VJ的table后，用前兩列和count或者freq（最好freq）,分別作為"TCR1", "TCR2","value" 我發(fā)現(xiàn)最近總忘記寫簡書
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2022-10-12 R包pwr統(tǒng)計功效
先用excel算出兩組數(shù)的平均值μ1和μ2，=STDEV(選中所有數(shù)據(jù))算出均方誤差：MSE，也就是σ^2=SQRT(MSE) 均方誤差開根號： σd=(μ1-μ2)/ σ
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2022-10-7 TCRdist clustering tree預期效果: 在github上找到tcrdistGitHub - 普布拉德利/TCR-dist：用于分析表位特異性T細胞受體（TCR）庫的軟件工具[https://github...
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2022-10-09 Perl & VDJ pair在linux下先放gz文件，用perl腳本，注意輸入示例為3B.clonotypes.TRB.txt，表頭是：count freq cdr3nt cdr3aa ...