基因功能注釋，簡(jiǎn)單來說，即是根據(jù)已有的蛋白庫，對(duì)從基因組上提取到的蛋白序列進(jìn)行比對(duì)，從而獲得相應(yīng)的信息。 這里整理了擬南芥、Uniprot、Swissprot和Interpr...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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基因功能注釋 -
軟件8 —— salmon一、 基本介紹 Salmon是一款新的、極快的轉(zhuǎn)錄組計(jì)數(shù)軟件。它與Kallisto和Sailfish類似，可以不通過mapping而獲得基因的counts值。Salmon的...
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Salmon 進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本定量Salmon 是轉(zhuǎn)錄本定量軟件，使用轉(zhuǎn)錄本定量主要優(yōu)點(diǎn)一是更準(zhǔn)確，比如不同樣本同一基因使用不同 isoform 此時(shí)基因長(zhǎng)度并不相等，直接基因定量無法顧及；二是方便進(jìn)行可變剪...
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高級(jí)heatmap繪制ComplexHeatmappheatmap[http://www.itdecent.cn/p/b0b28ee8993d]ComplexHeatmap handbook[https://jokergo...
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過去說complexheatmap太復(fù)雜，是我太菜了寫在前面 之前曾抱怨過complexheatmap太復(fù)雜了，現(xiàn)在我想說是我太菜了。折騰了一圈complexheatmap后，發(fā)現(xiàn)complexheatmap真的是極致全面的一...
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2021-09-16
ParaAT2.0 下載和安裝 接觸Linux第一天，短期目標(biāo)是Ka/Ks計(jì)算 參考好幾位網(wǎng)友大神的帖子開始linux系統(tǒng)中Ka/Ks的計(jì)算 首先用wget 下載 Para2...
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R語言中dplyr包join函數(shù)之目前我看到過的最形象的教程所涉及的函數(shù) Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
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關(guān)于 dplyr 1.0.0 出來后我想分享的一些東西于 2020-05-29 那天，期盼已久的 dplyr 1.0.0 終于出來了（emm，鴿了半個(gè)月）。 dplyr 在出 1.0.0 版本之前不久，于 hadely 在 tw...
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RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差異基因分析→ggplot2作火山圖→biomaRt轉(zhuǎn)換ID并注釋請(qǐng)一定看這里：寫下來只是為了記錄一些自己的實(shí)踐，當(dāng)然如果能對(duì)你有所幫助那就更好了，歡迎大家和我交流 差異分析流程: 1 初始數(shù)據(jù) 2 標(biāo)準(zhǔn)化(normalization)：D...
