基因功能注釋,簡單來說,即是根據(jù)已有的蛋白庫,對從基因組上提取到的蛋白序列進(jìn)行比對,從而獲得相應(yīng)的信息。 這里整理了擬南芥、Uniprot、Swissprot和Interpr...
一、 基本介紹 Salmon是一款新的、極快的轉(zhuǎn)錄組計數(shù)軟件。它與Kallisto和Sailfish類似,可以不通過mapping而獲得基因的counts值。Salmon的...
Salmon 是轉(zhuǎn)錄本定量軟件,使用轉(zhuǎn)錄本定量主要優(yōu)點(diǎn)一是更準(zhǔn)確,比如不同樣本同一基因使用不同 isoform 此時基因長度并不相等,直接基因定量無法顧及;二是方便進(jìn)行可變剪...
pheatmap[http://www.itdecent.cn/p/b0b28ee8993d]ComplexHeatmap handbook[https://jokergo...
寫在前面 之前曾抱怨過complexheatmap太復(fù)雜了,現(xiàn)在我想說是我太菜了。折騰了一圈complexheatmap后,發(fā)現(xiàn)complexheatmap真的是極致全面的一...
ParaAT2.0 下載和安裝 接觸Linux第一天,短期目標(biāo)是Ka/Ks計算 參考好幾位網(wǎng)友大神的帖子開始linux系統(tǒng)中Ka/Ks的計算 首先用wget 下載 Para2...
所涉及的函數(shù) Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
于 2020-05-29 那天,期盼已久的 dplyr 1.0.0 終于出來了(emm,鴿了半個月)。 dplyr 在出 1.0.0 版本之前不久,于 hadely 在 tw...
請一定看這里:寫下來只是為了記錄一些自己的實(shí)踐,當(dāng)然如果能對你有所幫助那就更好了,歡迎大家和我交流 差異分析流程: 1 初始數(shù)據(jù) 2 標(biāo)準(zhǔn)化(normalization):D...
原英文文檔地址:https://raw.githubusercontent.com/kassambara/rstatix/master/README.Rmd rstatix ...