一個(gè)不太年輕的新手，歡迎交流學(xué)習(xí)。
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水調(diào)歌頭丙辰中秋，歡飲達(dá)旦，大醉，作此篇，兼懷子由。 明月幾時(shí)有，把酒問(wèn)青天。不知天上宮闕，今夕是何年。我欲乘風(fēng)歸去，又恐瓊樓玉宇，高處不勝寒。起舞弄清影，何似在人間。 轉(zhuǎn)朱閣，低綺...
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可以寫一個(gè)ANNOVAR 或 SnpEff 或 VEP 進(jìn)行注釋的教程么？謝謝您這篇精彩的教程，很有幫助
Mr_hot 評(píng)論自RNA-seq 檢測(cè)變異之 GATK 最佳實(shí)踐流程 -
請(qǐng)繼續(xù) 寫下去，github沒(méi)有中文注釋，也有些看不懂
RNAseq教程(4.5)
目錄 1.Module 1 - Introduction to RNA sequencing Installation[http://www.itdecent.cn/p/0...
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RNA-seq(10):KEGG通路可視化:gage和pathview這部分直接從上部分RNA-seq(9):富集分析(功能注釋)[http://www.itdecent.cn/p/5d82acad6008]的數(shù)據(jù)而來(lái)，當(dāng)然如果你上部分?jǐn)?shù)據(jù)存...
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如何優(yōu)雅展示GO富集結(jié)果圖片好像加載不出來(lái)，可移步：https://blog.csdn.net/qq_38774801/article/details/114952565[https://blog....
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RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實(shí)戰(zhàn)練習(xí)前言 這次給大家?guī)?lái)的是16年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章：Transcript-level expression analy...
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關(guān)于stringtie定量基因的時(shí)候，最后輸出很多MSTRG樣式的geneid相信大家在用hisat2-stringtie-DESeq2這一套流程做差異表達(dá)基因分析的時(shí)候的時(shí)候，最后會(huì)輸出很多帶MSTRG字樣的geneid。 我一開(kāi)始搜索這個(gè)問(wèn)題，...
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Stringtie的使用
本文用作個(gè)人學(xué)習(xí)，全部摘抄于Stringtie說(shuō)明書中文翻譯版參考鏈接：Stringtie說(shuō)明書參考鏈接：Stringtie說(shuō)明書中文翻譯版 StringTie的基本用法： ...
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獲取基因組的bed、gtf注釋文件先來(lái)看一下常見(jiàn)的基因組注釋格式 bed gtf gff 需要特別注意的是，bed的每一行記錄是左閉右開(kāi)區(qū)間，并且以0作為染色體的起始；而gtf的每一行記錄是包括區(qū)間的兩端的，...
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Biopython之gbff轉(zhuǎn)gff格式 2020-04-27gbff是NCBI基因組數(shù)據(jù)庫(kù)常見(jiàn)的基因組genebank格式文件，在實(shí)際分析中，常常需要gff格式或者gtf格式，所以就存在gbff轉(zhuǎn)換gff格式的需求image.png ...
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無(wú)參轉(zhuǎn)錄組序列組裝 — Trinity轉(zhuǎn)錄組分析策略 轉(zhuǎn)錄組分析策略根據(jù)有無(wú)參考轉(zhuǎn)錄組可以分為兩類： 有參比對(duì)—定量—差異分析—功能富集分析等 無(wú)參組裝—定量—差異分析—功能富集分析等image 無(wú)參考轉(zhuǎn)錄組序列...
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好多APP都花里胡哨的，背離了最初的意義。真的自律，還需要這種東西？試過(guò)一段時(shí)間，感覺(jué)在我強(qiáng)行拼湊 ，所以后來(lái)都不用了。只要壓力大，沒(méi)有什么自律部自律。
大學(xué)-《大學(xué)生必備手機(jī)APP》學(xué)習(xí)·自律
希望成千上萬(wàn)的大學(xué)生們，早點(diǎn)看到我的這篇“血淚文”。 不要像我一樣在大學(xué)的尾巴才開(kāi)始覺(jué)悟?。。≌湎Ш米约旱拇髮W(xué)生活?。?一、學(xué)習(xí)［英語(yǔ)，計(jì)算機(jī)二級(jí)，駕駛，教師資格，普通話］ ...
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畫樹(shù)用mage，
煙草轉(zhuǎn)錄因子WRKY70的啟動(dòng)子分析
這是我替同事做的一個(gè)啟動(dòng)子順式元件預(yù)測(cè)，簡(jiǎn)單介紹下流程。 目的：從同事的描述中，我大概確定客戶想研究WRKY70轉(zhuǎn)錄因子對(duì)煙草抗逆性的調(diào)控，并且想對(duì)自己的啟動(dòng)子做一個(gè)順式元件...
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hhhhh程老師看不下去了
基因家族分析四(繪制基因家族motif圖)
一：搜索其他保守蛋白結(jié)構(gòu)域 需要準(zhǔn)備的文件有：NBS蛋白序列，TIR.hmm和RPW8.hmm 二：擬南芥NPS基因家族含有哪些motif 識(shí)別motif的軟件用meme。 ...
