輸入按坐標(biāo)排序過(guò)的bam比對(duì)結(jié)果文件和bed區(qū)間信息文件，統(tǒng)計(jì)bed文件中，目標(biāo)區(qū)間內(nèi)比對(duì)結(jié)果的深度信息。 關(guān)于SAM/BAM格式的介紹，參考分析模塊 "Map with B...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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read depth per BED region with BAM file（目標(biāo)區(qū)域深度統(tǒng)計(jì)）
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基因組瀏覽器、BAM文件可視化工具（1）--- Tablet在高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的處理中（例如，在重測(cè)序研究、組裝結(jié)果的re-mapping校正中），我們經(jīng)常會(huì)將測(cè)序reads與參考序列進(jìn)行比對(duì)（常見(jiàn)的如BWA、Bowtie等工具），并將...
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「TBtools plugin」WGCNA shiny 使用說(shuō)明原本以為畢業(yè)了就起飛了，沒(méi)想到，喵的比沒(méi)畢業(yè)還累...又鴿了仨月，這個(gè)小插件到時(shí)完善了不少，但是上次承諾的視頻還是沒(méi)有錄。原因不說(shuō)了，準(zhǔn)備手打！ 還是寫(xiě)個(gè)教程為好。錄視頻，怕...
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如何使用SPDE進(jìn)行共線性分析（MCScanX）在進(jìn)行共線性分析的時(shí)候需要準(zhǔn)備兩個(gè)文件：一個(gè)是blast文件，一個(gè)是gff文件。這兩個(gè)文件都是需要經(jīng)過(guò)相應(yīng)處理的。在這里還是稍微跟同學(xué)們說(shuō)一下原理：共線性的本質(zhì)其實(shí)就是找序列...
