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    單細(xì)胞-KEGG/GO富集分析

    前提:基于cluster的差異基因原理:超幾何檢驗(yàn),找出與整個基因組背景相比,在顯著性差異表達(dá)基因中顯著富集的GO、KEGG條目(p<0.05:一般說明這個條目是有差異的) ...

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    單細(xì)胞-差異基因分析

    背景前提:1:一個Cluster和剩下的所有細(xì)胞的差異分析,反映的是各個Cluster的特征;2:組間差異分析(類似經(jīng)典組學(xué)差異比較;需要樣品送齊) 意義:1:找出每個聚類中...

  • samtools—手冊

    官方手冊:http://www.htslib.org/doc/samtools.html[http://www.htslib.org/doc/samtools.html] S...

  • mRNA-seq學(xué)習(xí)(二):Bowtie2比對

    1. 比對之前需要考慮哪些問題 1. 選什么作為參考序列 基因組序列既能做表達(dá)定量,還能發(fā)現(xiàn)新的基因和轉(zhuǎn)錄本 轉(zhuǎn)錄本序列(CDS / cDNA / 基因集)表達(dá)定量 2 gf...

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