Whittaker（1972）提出了以下三種多樣性。 Alpha多樣性（α多樣性），指某個(gè)群落或生境內(nèi)部的種的多樣性。這個(gè)指標(biāo)是指一個(gè)群落內(nèi)物種的個(gè)數(shù)(species ric...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江西
-
群落多樣性-Alpha指數(shù) -
-
第六章 群體多樣性計(jì)算和測(cè)量6.1 Vdr?/?小鼠數(shù)據(jù)集 小鼠腸道微生物組數(shù)據(jù)(金等人)。(2015年)是從維生素D受體基因敲除(維生素D受體?/?)和野生型(WT)小鼠的糞便和盲腸糞便中產(chǎn)生的，具有...
-
R語(yǔ)言相關(guān)性檢驗(yàn)函數(shù)2021.3.111. 相關(guān)性檢驗(yàn) 得出相關(guān)系數(shù)我們并不一定能得出數(shù)據(jù)之間的相關(guān)水平，這時(shí)候我們會(huì)進(jìn)行相關(guān)性檢驗(yàn)來(lái)進(jìn)行量化。置信區(qū)間:confidence interval，是指由由樣本統(tǒng)計(jì)量...
-
T檢驗(yàn)、F檢驗(yàn)和卡方檢驗(yàn)
T檢驗(yàn)、F檢驗(yàn)、卡方檢驗(yàn)是統(tǒng)計(jì)學(xué)中常見(jiàn)的假設(shè)檢驗(yàn)，今天記錄下這幾個(gè)假設(shè)檢驗(yàn)的原理和應(yīng)用場(chǎng)景。 檢驗(yàn)方法應(yīng)用場(chǎng)景T檢驗(yàn)比較兩個(gè)樣本均值是否有差異F檢驗(yàn)比較兩個(gè)及兩個(gè)以上樣本均值...
-
R語(yǔ)言做主坐標(biāo)分析（PCoA）的一個(gè)簡(jiǎn)單小例子最近好幾位讀者在公眾號(hào)后臺(tái)留言PCoA。今天的推文就來(lái)簡(jiǎn)要的介紹一下PCoA在R語(yǔ)言里實(shí)現(xiàn)的代碼。具體的原理我自己也沒(méi)有看明白。目前的理解是：這個(gè)PCoA(主坐標(biāo)分析)和主成...
-
R語(yǔ)言三大繪圖R包之三---ggstatsplot美圖神器ggstatsplot-專為學(xué)術(shù)論文而生 在CRAN(comprehensive R Achive Netwokrk)中已有13000多個(gè)R包了簡(jiǎn)單講ggstatsp...
-
R數(shù)據(jù)分析 利用dplyr包將已有的數(shù)值列轉(zhuǎn)換為百分?jǐn)?shù)列
數(shù)據(jù)分析中, 我們有時(shí)候會(huì)有這樣的需求, 比如將已有的數(shù)值列,轉(zhuǎn)化為百分位列。 Case study1: 比如說(shuō)我們有如下表格，代表了ATGC四種堿基的絕對(duì)個(gè)數(shù)。 我們現(xiàn)在想...
-
PCA分析1.數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化 為了統(tǒng)一數(shù)據(jù)的量綱并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行中心化，在主成分分析之前往往需要對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。下面以R語(yǔ)言自帶的iris范例數(shù)據(jù)集為例，探索一下主成分分析的具體過(guò)程。 ...
