首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具,為生信分析做圖帶來了極大的便利。作為生信小白,在做多物種間共線性分析時(shí),嘗試了多種方法,苦于沒有計(jì)算機(jī)基礎(chǔ),一直沒能完成...
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選擇壓力及基因在進(jìn)化過程中所受到的壓力,也稱自然選擇。 在遺傳學(xué)中, Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同義突變頻率(Ka)和同義突變頻率(Ks)之間的比例。 一般認(rèn)為,同義...
參考這些主要根據(jù)這篇操作?。?![http://www.itdecent.cn/p/970012d1b051/]??????我覺得學(xué)RNA-seq必看的文獻(xiàn)??!??????[https:...
1 比對(duì)的目的 1.1 差異表達(dá)基因只需要確定不同的read計(jì)數(shù),可以用bowtie, bwa這類比對(duì)工具,或者是salmon這類align-free工具,并且后者的速度更快...
1 參考基因組 以下內(nèi)容主要參考jimmy大佬的生信技能樹及生信菜鳥團(tuán)公眾號(hào) 1.1 【直播】我的基因組(五):測(cè)試數(shù)據(jù)及參考基因組的準(zhǔn)備 這個(gè)對(duì)新手來說,是一個(gè)很大的坑,h...
1 基礎(chǔ)了解 NGS008 測(cè)序常用名詞NGS009 生信常用數(shù)據(jù)格式NGS010 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控 2 fasta與fastq 一般NGS測(cè)序數(shù)據(jù)均為Fastq格式FASTQ格...
主要參考生信技能樹RNA-seq基礎(chǔ)入門 http://www.biotrainee.com/thread-1750-1-1.html 1. 系統(tǒng)準(zhǔn)備 Win10自帶Ubun...
傳送門: RNAseq006 轉(zhuǎn)錄組入門(6):reads計(jì)數(shù)RNAseq005 轉(zhuǎn)錄組入門(5):序列比對(duì)RNAseq004 轉(zhuǎn)錄組入門(4):參考基因組下載RNAseq0...