轉(zhuǎn)自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因組重測序是通過對已有參考序列（...
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全基因組重測序基礎(chǔ)及高級分析知識匯總
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NLR-Annotator工具鑒定NBS-LRR位點一、NLR-Annotator下載及環(huán)境部署 NLR-Annotator 是Steuernagel利用JAVA開發(fā)用以從基因組DNA序列上直接鑒定NLR loci的工具，相關(guān)...
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分析 | 比較基因組 | 共線性分析
網(wǎng)上已經(jīng)有很多教程，自己嘗試梳理。 共線性分析，你會想到什么？基于蛋白編碼基因1.1 MCScanX[https://github.com/wyp1125/MCScanX] ...
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200行代碼實現(xiàn)CNN卷積結(jié)果的可視化
圖一到圖四分別為：熱力圖+原圖、熱力圖、cam、原圖。 這里推薦： 本篇是根據(jù)該github上的layercam方法魔改的，也就是把常用的函數(shù)封裝到了一個文件里，并且不需要對...
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gff格式與gtf格式轉(zhuǎn)換——gffreadgff和gtf格式都可以儲存基因信息，但是不同的軟件對于文件格式的要求不同。 關(guān)于gff文件和gtf格式的詳細(xì)介紹，可以參見生信技能樹，簡單的區(qū)別對比見下表。http://w...
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【軟件使用】PyMol基礎(chǔ)教程寫在前面本篇主要介紹PyMol的基礎(chǔ)操作，有了前面入門基礎(chǔ)以后，這一篇學(xué)起來會很快的。 1.命令輸入窗口 優(yōu)先選擇輸入框1。 2.查看切換工作路徑(pwd) ????默認(rèn)打開...
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暫別簡書，后會有期
我不是老師，也不是大神，更不是前輩。我只是個普通的科研工作者，一個只想努力變得更好的人。 來到簡書快3年了，期間寫了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時wfh的時候?qū)懙?。至?..
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如何對基因組序列進行注釋基因組組裝完成后，或者是完成了草圖，就不可避免遇到一個問題，需要對基因組序列進行注釋。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
