問(wèn)題產(chǎn)生：有一天科室?guī)熋脝?wèn)：為什么我保存出來(lái)的數(shù)據(jù)，用excel打開(kāi)后列名總是被左移了一位？有沒(méi)有解決辦法。答曰：直接在excel把他往右拖一位。師妹：可是我有二十多個(gè)這樣的...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：四川
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2020-05-22[R]write.table時(shí)列名總是左移一位？補(bǔ)幾行小代碼完美解決
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請(qǐng)問(wèn)一下，大佬們已經(jīng)解決了嘛
STEP6:WGCNA相關(guān)性分析
因?yàn)闃颖緮?shù)量比較可觀，所以可以進(jìn)行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來(lái)做WGCNA分析，挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合，或者顯著差異表達(dá)的基因集合等等。...
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老師你好執(zhí)行模塊與性狀相關(guān)性代碼時(shí)出現(xiàn)了下標(biāo)出界的報(bào)錯(cuò)，請(qǐng)問(wèn)老師這是哪里出錯(cuò)了??
洪曉齡 評(píng)論自STEP6:WGCNA相關(guān)性分析 -
最近不常登陸簡(jiǎn)書(shū)，若評(píng)論問(wèn)題沒(méi)有及時(shí)回復(fù)，可以發(fā)郵件交流 bioinfortime@163.com
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STEP6:WGCNA相關(guān)性分析因?yàn)闃颖緮?shù)量比較可觀，所以可以進(jìn)行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來(lái)做WGCNA分析，挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合，或者顯著差異表達(dá)的基因集合等等。...
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MEGA 構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)步驟
【轉(zhuǎn)載】 分子進(jìn)化的研究對(duì)象是核酸和蛋白質(zhì)序列。研究某個(gè)基因的進(jìn)化，是用它的DNA序列，還是翻譯后的蛋白質(zhì)序列呢？序列的選取要遵循以下原則：1）如果DNA序列的兩兩間的一致度...
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跟著Nature Communications學(xué)畫(huà)圖：R語(yǔ)言ggplot2畫(huà)帶有底紋的柱形圖論文是 Bioactivity descriptors for uncharacterized chemical compounds 本地存儲(chǔ)文件名 s41467-021-2...
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生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)<br>公眾號(hào)：生信學(xué)習(xí)手冊(cè)
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類(lèi)熱圖 pheatmap前言 在前面的章節(jié)中，我們介紹了如何使用 ggplot2 繪制熱圖 ggplot2 繪制熱圖的方式很多，如 geom_raster、geom_tile 等 但通常僅僅繪制熱圖...
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PhD student in Biology | Genomics | Evolution | TSS | python | R | Machine Learning | R package develop<br>
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用pheatmap畫(huà)熱圖
假裝是前言 學(xué)了很久的R，一直也沒(méi)啥進(jìn)展，之前一直覺(jué)得R不是很容易的東西嗎，復(fù)制粘貼代碼就好了。。emmm，太年輕太年輕。。 我用R的日常就是畫(huà)熱圖，各種各樣的熱圖。所以網(wǎng)上...
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之前對(duì)R語(yǔ)言和Linux是沒(méi)有一點(diǎn)基礎(chǔ)，所以詳細(xì)記錄怎么入門(mén)以及如何使用。R語(yǔ)言應(yīng)用很廣，知識(shí)很多，生信分析主要常用哪些知識(shí)，牢牢掌握那些知識(shí)點(diǎn)且應(yīng)用熟練。
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R語(yǔ)言-第一次用RStudio 畫(huà)熱圖作業(yè) 1.read.table參數(shù)理解 file:文件名（包在“”內(nèi)，或者使用一個(gè)字符型變量），可能需要全程路徑（注意即使是在windows下，符號(hào)\也不允許包含在內(nèi)，必須使...
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研究方向：基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、遺傳學(xué)<br>邊做邊分享，超不定期更新
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轉(zhuǎn)錄組趨勢(shì)分析基本概念 表達(dá)趨勢(shì)分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類(lèi)到一種變化趨勢(shì)中，從而找到實(shí)驗(yàn)變化過(guò)程中最具有代表性的基因集以及對(duì)應(yīng)的趨勢(shì)...
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淺淺的學(xué)習(xí)歷程<br>生信新手，打工人，搬運(yùn)工。<br>像王子文一樣財(cái)務(wù)自由，才可實(shí)現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致，才可實(shí)現(xiàn)職業(yè)自由
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富集分析GO，KEGG，DO等市面上公司做RNA-Seq的一般流程是： tophat2 ---> Cufflinks ---> Cuffdiff ---> R tophat2是把reads回帖到基因組上；...
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請(qǐng)問(wèn)一下，這里用的表達(dá)量是count值還是fpkm值
轉(zhuǎn)錄組趨勢(shì)分析
基本概念 表達(dá)趨勢(shì)分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類(lèi)到一種變化趨勢(shì)中，從而找到實(shí)驗(yàn)變化過(guò)程中最具有代表性的基因集以及對(duì)應(yīng)的趨勢(shì)...
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