發(fā)簡信
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人類基因組的Phasing原理是什么？什么是Phasing？ Phasing，或者說Genotype Phasing，它的中文名有很多：基因定相、基因分型、單倍體分型、單倍體構(gòu)建等在不同的語境下都有人說過。但不管...
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「r<-配置」Rprofile：R 全局設(shè)置
與文章 【r<-安裝|方案】Windows R安裝與配置 相關(guān)。 存儲(chǔ)在 ~/.Rprofile 中的內(nèi)容是一個(gè) R 腳本，它會(huì)在 R 啟動(dòng)時(shí)自動(dòng)運(yùn)行，所以可以作為全局的配置...
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遺傳學(xué) 博士
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植物：<br>細(xì)胞遺傳<br>系統(tǒng)進(jìn)化<br>wudandan90@163.com
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5、RNAseq(5)--reads count(htseq-count)與基因注釋（bioMart）理論基礎(chǔ) 在上篇的比對中，我們需要糾結(jié)是否真的需要比對，如果你只需要知道已知基因的表達(dá)情況，那么可以選擇alignment-free工具（例如salmon, sailfish...
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4、RNAseq(4)--Hisat2進(jìn)行序列比對及Samtools格式轉(zhuǎn)化概況：使用處理后的fastq文件和基因組與轉(zhuǎn)錄組比對，確定在轉(zhuǎn)錄組或者基因組中的關(guān)系。在轉(zhuǎn)錄組和基因組的比對采取的方案不同。分別是ungapped alignment to ...
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華西師兄傾情推薦|小白學(xué)機(jī)器學(xué)習(xí)的經(jīng)典書籍和資源這都有作者簡介 本文作者大可，四川大學(xué)華西醫(yī)院腫瘤中心科研搬磚工，研究興趣包括機(jī)器學(xué)習(xí)在高維組學(xué)問題中的應(yīng)用，預(yù)測模型的開發(fā)與驗(yàn)證。已發(fā)表多篇生信和機(jī)器學(xué)習(xí)相關(guān)sci文章。 編輯審...
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R小姐：mice 多重插補(bǔ)
答應(yīng)大家今天要寫一寫關(guān)于多重插補(bǔ)的文章。查閱了很多資料，發(fā)現(xiàn)了一篇非常棒的英文文獻(xiàn)，翻譯給大家。 附上原文鏈接： 文章名稱：mice: Multivariate Imputa...
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特異度（specificity）與靈敏度（sensitivity）前言 在論文閱讀的過程中，經(jīng)常遇到使用特異性（specificity）和靈敏度（sensitivity）這兩個(gè)指標(biāo)來描述分類器的性能。對這兩個(gè)指標(biāo)表示的含有一些模糊，這里查閱...
