EDTA是一個(gè)非常好的轉(zhuǎn)座子注釋流程，并且它有一個(gè)功能是可以根據(jù)突變速率推算LTR插入時(shí)間。然而，這個(gè)軟件如果不設(shè)置參數(shù)--u的話，會(huì)使用禾本科的默認(rèn)插入時(shí)間1.3e-8來計(jì)...
IP屬地：河南
-
根據(jù)突變速率進(jìn)行EDTA結(jié)果的LTR插入時(shí)間換算
-
-
TEtranscripts--計(jì)算轉(zhuǎn)座子(TEs)在RNA-seq中的定量和差異表達(dá)
寫在前面，最近為了解決這個(gè)問題，看了很多軟件，要么是單細(xì)胞技術(shù)，要么是物種限制，總之花了挺多時(shí)間。本來打算使用SQuIRE，但是卡在了BUILD_refGene.txt(基因...
-
生信分析22：完整的轉(zhuǎn)座子注釋流程本次推送是文獻(xiàn)分享22的對(duì)應(yīng)內(nèi)容。我與生信，公眾號(hào)：我與生信文獻(xiàn)分享22：泛基因組解析柑橘亞科進(jìn)化以及柑橘果實(shí)中檸檬酸積累的關(guān)鍵基因[http://mp.weixin.qq....
-
入門必看 | 深度解析長末端重復(fù)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（LTR-RTs）（轉(zhuǎn)發(fā)）入門必看 | 深度解析長末端重復(fù)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（LTR-RTs） 諾禾致源[http://www.itdecent.cn/u/ee00dc6faab7]已關(guān)注 0.54220...
-
-
根據(jù)基因組以及gff3文件提取4dtv位點(diǎn)
現(xiàn)在很多文章都關(guān)注4dtv位點(diǎn)，小編接下來分享下根據(jù)基因組以及gff3提取所有基因的4dtv位點(diǎn)的perl腳本： 運(yùn)行程序： 注：該腳本小編不知道來源幾何，雖在此分享，若有侵...
