請問.rstudio這個(gè)文件夾在哪里呢？
如何解決RStudio Server: R is taking longer to start than usualRstudio server 在運(yùn)行的時(shí)候自己斷掉了，重新登錄提示：RStudio Server: R is taking longer to start than usua...
發(fā)簡信
IP屬地：湖北
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immunedeconv踩坑記錄
immunedeconv包號稱可以利用多種算法進(jìn)行免疫細(xì)胞比例計(jì)算，包括quantiseq、timer、cibersort、cibersort_abs、mcp_counter...
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免疫細(xì)胞估算R包immunedeconv安裝immunedeconv這個(gè)R包是一個(gè)免疫細(xì)胞比例估算集大成者，把常見的免疫細(xì)胞估算的算法都包括進(jìn)去了，包括quantiseq、timer、cibersort、ciberso...
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29個(gè)免疫特征的基因集（16種免疫細(xì)胞和13種免疫功能評分）基因列表TCGA風(fēng)險(xiǎn)模型類生信文章中，經(jīng)常會對高低風(fēng)險(xiǎn)組進(jìn)行16種免疫細(xì)胞和13種免疫功能評分的比較，就會用到一個(gè)29個(gè)免疫特征的基因集（16種免疫細(xì)胞和13種免疫功能評分），如下圖...
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ＴＣＧＡ和GＴＥｘ的數(shù)據(jù)聯(lián)合分析實(shí)戰(zhàn)0.緣起 很多文章中用到GEPIA這個(gè)網(wǎng)頁工具來進(jìn)行TCGA和GTEx表達(dá)量的聯(lián)合比較，但在此之前我不知道要怎樣在R語言中實(shí)現(xiàn)。?這個(gè)GEPIA的文章里說： The imba...
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veen_eles = list(`Filt_low_umi\n(300)` = umi_low,
`Filt_high_umi\n(8000)` = umi_high,
`Filt_high_mito\n(14%)` = mito,
`Filt_high_ribo\n(3%)` = ribo)
library("ggVennDiagram")
這里提示沒有umi_low復(fù)現(xiàn)2：AD與Normal細(xì)胞類型水平的差異基因挖掘(snRNA-seq)
Single-nucleus transcriptome analysis reveals dysregulation of angiogenic endothelial c...
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【科研熱點(diǎn)】雙硫死亡相關(guān)基因集前面小編跟大家分享過一些科研熱點(diǎn)相關(guān)的基因集 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
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【科研熱點(diǎn)】氧化應(yīng)激基因前面小編跟大家分享過一些科研熱點(diǎn)相關(guān)的基因集 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
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答讀者問(8)：如何批量查詢marker基因(對應(yīng)的蛋白)會不會在膜上表達(dá)？做實(shí)驗(yàn)的朋友們對這個(gè)問題應(yīng)該是很感興趣的，因?yàn)樯婕暗胶罄m(xù)能不能實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文獻(xiàn)，查網(wǎng)站。我知道的：uniprot、PDB、the human...
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花生殼https無法映射Rstudio-server的解決方案之前把服務(wù)器放在家里，通過花生殼軟件進(jìn)行內(nèi)網(wǎng)穿透，采用http協(xié)議進(jìn)行映射。后來由于一些原因，http協(xié)議不能使用了，只能使用https。這個(gè)時(shí)候花生殼軟件映射Rstudio...
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修改ssh中l(wèi)inux命令行配色ssh進(jìn)行l(wèi)inux遠(yuǎn)程登錄時(shí)，用戶名、服務(wù)器名字都是一片白，也不顯示時(shí)間，如下圖： 生信技能樹賣萌哥老師提供了兩句代碼： 直接在ssh（以xshell為例）登錄后界面中粘貼...
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@16fdc427cd90
pdf(file="x.pdf",width=8,height=6)
plotly::ggplotly(rssPlot$plot)
dev.off()
試試pySCENIC的轉(zhuǎn)錄因子分析及數(shù)據(jù)可視化（三）
參考生信技能樹：pyscenic的轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果展示之5種可視化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
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STRING進(jìn)行的PPI分析？
pySCENIC的轉(zhuǎn)錄因子分析及數(shù)據(jù)可視化（三）
參考生信技能樹：pyscenic的轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果展示之5種可視化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
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library(SCENIC)一下，看你SCENIC包安裝成功沒有。
pySCENIC的轉(zhuǎn)錄因子分析及數(shù)據(jù)可視化（三）
參考生信技能樹：pyscenic的轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果展示之5種可視化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
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結(jié)合TCGAbiolinks批量下載TCGA臨床信息
TCGAbiolinks包常用來TCGA的下載和各種常用分析，本人在使用TCGAbiolinks下載和整理TCGA臨床信息時(shí)碰到一些麻煩，具體如下： TCGAbiolinks...
