創(chuàng)建circexplorer3環(huán)境 python版本需為2.7+ 軟件版本問(wèn)題 注意:Samtools=0.1.18.0,Bowtie=1.0.0.0,tophat=2.0....
創(chuàng)建circexplorer3環(huán)境 python版本需為2.7+ 軟件版本問(wèn)題 注意:Samtools=0.1.18.0,Bowtie=1.0.0.0,tophat=2.0....
tags: tophat-fusion tophat-fusion 報(bào)錯(cuò) RNA-seq 數(shù)據(jù)檢測(cè)融合基因,在 tophat-fusion 這一步報(bào)錯(cuò): 第一次運(yùn)行的是 to...
寫在前面的廢話 我可能不適合做科研,因?yàn)槲铱偸菍?duì)一些“沒(méi)有必要”的事斤斤計(jì)較~ 剛開(kāi)始接觸二代測(cè)序時(shí),是跟著Jimmy大神從RNA-seq開(kāi)始入門的。那時(shí)候使用的比對(duì)工具是H...
bedtools軟件一款強(qiáng)大的基因組數(shù)據(jù)處理工具集,如序列提取,合并,拆分等 1、軟件的安裝兩種方式 第一種下載軟件安裝,進(jìn)入到自己存放軟件的文件夾 下載完后解壓 mkae ...
[轉(zhuǎn)載]RNA-seq :TopHat2 + Cufflinks分析流程 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制:fastqc軟件 使用方法: 參數(shù)說(shuō)明:-o: 輸出文件所在目錄,并且是已經(jīng)存在的...
hisat2的安裝 1.下載 運(yùn)行結(jié)果 2.解壓 結(jié)果 一般源代碼安裝需編譯后再安裝,編譯前需要檢查配置,即執(zhí)行./configure命令來(lái)完成,但hisat2不需要執(zhí)行./...
之前要下載一個(gè)大數(shù)據(jù),從NCBI上下載比較慢,聽(tīng)了洲更建議,我就去ENA上下載,確實(shí),下載很人性化,而且還有一個(gè)java的下載器,速度快,還方便選擇。 但是,最近我突然無(wú)法從...
NCBI(National Center for Biotechnology Information)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/[https:...
目錄1、FGSM原理2、pytorch實(shí)現(xiàn)2.1 建立模型2.2 FGSM模塊2.3 測(cè)試2.4 可視化對(duì)比2.5 對(duì)比樣本與對(duì)抗樣本 1、FGSM原理 論文 Explain...
前面文章[https://shenzl.blog.csdn.net/article/details/128617956]講了PyTorch的基本原理,本篇正式用PyTorch...
日期:2019年2月2日——2019-Week5分類:「綜述+資源」題目:A primer on deep learning in genomicsDOI: https://...