創(chuàng)建circexplorer3環(huán)境 python版本需為2.7+ 軟件版本問(wèn)題 注意：Samtools=0.1.18.0，Bowtie=1.0.0.0，tophat=2.0....
發(fā)簡(jiǎn)信
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CIRCexplorer3 | 踩坑之路
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融合基因檢測(cè) tophat-fusion 報(bào)錯(cuò) "basic_exception.h:236 FAILED" 解決方案
tags： tophat-fusion tophat-fusion 報(bào)錯(cuò) RNA-seq 數(shù)據(jù)檢測(cè)融合基因，在 tophat-fusion 這一步報(bào)錯(cuò)： 第一次運(yùn)行的是 to...
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生信坑底躺著不動(dòng)的男人<br>簡(jiǎn)書不常在，有問(wèn)題可私信
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那令人困惑的比對(duì)工具選擇啊~
寫在前面的廢話 我可能不適合做科研，因?yàn)槲铱偸菍?duì)一些“沒(méi)有必要”的事斤斤計(jì)較~ 剛開(kāi)始接觸二代測(cè)序時(shí)，是跟著Jimmy大神從RNA-seq開(kāi)始入門的。那時(shí)候使用的比對(duì)工具是H...
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bedtools 安裝與使用
bedtools軟件一款強(qiáng)大的基因組數(shù)據(jù)處理工具集，如序列提取，合并，拆分等 1、軟件的安裝兩種方式 第一種下載軟件安裝，進(jìn)入到自己存放軟件的文件夾 下載完后解壓 mkae ...
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[轉(zhuǎn)載]RNAseq: TopHat2 + Cufflinks分析流程
[轉(zhuǎn)載]RNA-seq :TopHat2 + Cufflinks分析流程 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制：fastqc軟件 使用方法： 參數(shù)說(shuō)明：-o: 輸出文件所在目錄，并且是已經(jīng)存在的...
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Hisat2 安裝hisat2的安裝 1.下載 運(yùn)行結(jié)果 2.解壓 結(jié)果 一般源代碼安裝需編譯后再安裝，編譯前需要檢查配置，即執(zhí)行./configure命令來(lái)完成，但hisat2不需要執(zhí)行./...
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優(yōu)雅地做一名極客
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2018-06-15 如何加快（一點(diǎn)點(diǎn)）從NCBI上下載數(shù)據(jù)的速度
之前要下載一個(gè)大數(shù)據(jù)，從NCBI上下載比較慢，聽(tīng)了洲更建議，我就去ENA上下載，確實(shí)，下載很人性化，而且還有一個(gè)java的下載器，速度快，還方便選擇。 但是，最近我突然無(wú)法從...
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如何在NCBI下載數(shù)據(jù)（包括批量下載）？NCBI（National Center for Biotechnology Information）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/[https:...
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一條小咸魚(yú)
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對(duì)抗樣本之FGSM原理&實(shí)戰(zhàn)
目錄1、FGSM原理2、pytorch實(shí)現(xiàn)2.1 建立模型2.2 FGSM模塊2.3 測(cè)試2.4 可視化對(duì)比2.5 對(duì)比樣本與對(duì)抗樣本 1、FGSM原理 論文 Explain...
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深度學(xué)習(xí)&PyTorch 之 DNN-回歸
前面文章[https://shenzl.blog.csdn.net/article/details/128617956]講了PyTorch的基本原理，本篇正式用PyTorch...
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把寫作當(dāng)成一種修行
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「文獻(xiàn)05」深度學(xué)習(xí)應(yīng)用于基因組學(xué)的入門指導(dǎo)日期：2019年2月2日——2019-Week5分類：「綜述+資源」題目：A primer on deep learning in genomicsDOI: https://...
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最近不常登陸簡(jiǎn)書，若評(píng)論問(wèn)題沒(méi)有及時(shí)回復(fù)，可以發(fā)郵件交流 bioinfortime@163.com
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