參考教程：微信公眾號：生信星球批次效應處理實例：combat和removebatcheffect的對比 特別感謝：人美心善愛護小白的花花老師小潔忘了怎么分身 作為一個非常想搞...
發(fā)簡信
IP屬地：山東
-
生信小白--關(guān)于批次效應的學習及實戰(zhàn) -
無監(jiān)督一致性聚類Consensus Clustering(一致性聚類)，無監(jiān)督聚類方法，可根據(jù)不同組學數(shù)據(jù)集將樣本區(qū)分成幾個亞型，從而發(fā)現(xiàn)新的疾病亞型或者對不同亞型進行比較分析。 Conse...
-
2020-02-12 Day 25 用CIBERSORT分析腫瘤浸潤的免疫細胞（附代碼）因為在網(wǎng)上看了一些視頻，然后用數(shù)據(jù)試了一下，發(fā)現(xiàn)一直在運行，打開代碼一看，發(fā)現(xiàn)是我看不懂的，也不知道哪錯了，在網(wǎng)上搜了半天，不是要錢就是故意給你改錯的，網(wǎng)頁版的注冊還不成功，...
-
表達譜分析組織中細胞組分情況 --- CIBERSORT & xCell腫瘤微環(huán)境是近年來的研究熱點。復雜而動態(tài)的微環(huán)境中，腫瘤細胞與浸潤性免疫細胞、基質(zhì)細胞等相互作用，這在促進或抑制腫瘤生長、侵襲、轉(zhuǎn)移以及對病人臨床預后方面可能具有多方面的影響...
-
第一步：簡單的GEO數(shù)據(jù)提取及數(shù)據(jù)分析簡介 這是復現(xiàn)一篇結(jié)腸癌的文獻圖例，GSE4107，文獻地址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4399548/pdf/...
-
??[可視化|R包]ComplexHeatmap學習筆記①Introduction to ComplexHeatmap package
ComplexHeatmap包共分為以下9個部分來描述（重點要學會:OncoPrint） Introduction to ComplexHeatmap package Mak...
-
R package：circlize環(huán)狀熱圖1.讀取基因表達數(shù)據(jù) 這是我的基因表達量數(shù)據(jù) 1.1提取部分數(shù)據(jù)集 1.2提取基因表達值所在的列，組成新的矩陣，并將矩陣轉(zhuǎn)置 為什么要轉(zhuǎn)置，參考https://www.jia...
