1.為什么要在上機(jī)測(cè)序之前做PCR擴(kuò)增？ 測(cè)到的reads數(shù)取決于flowcell上長(zhǎng)了多少cluster（1個(gè)模板鏈擴(kuò)增出一簇分子），有多少cluster，理論上就得到多少...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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測(cè)序有關(guān)問(wèn)題
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DiseaseMeth 人類疾病相關(guān)的甲基化信息數(shù)據(jù)庫(kù)
DNA甲基化作為表觀遺傳的一種標(biāo)記，在生長(zhǎng)發(fā)育和疾病發(fā)生過(guò)程中扮演著重要角色。隨著大規(guī)模甲基化研究的進(jìn)行，積累了大量疾病相關(guān)的甲基化數(shù)據(jù)，DiseaseMeth就是一個(gè)保存了...
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iMETHYL : 整合了DNA甲基化, SNP和RNA_seq的多組學(xué)聯(lián)合數(shù)據(jù)庫(kù)
在NGS飛速發(fā)展的時(shí)代，有大量研究通過(guò)GSWA的方法，闡述了SNP于疾病之間的關(guān)聯(lián); 也有學(xué)者利用WGBS，RRBS, 甲基化芯片等方式研究DNA甲基化與疾病之間的關(guān)系。不過(guò)...
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MethyCancer : 癌癥相關(guān)的甲基化基因數(shù)據(jù)庫(kù)
癌癥作為人類健康的頭號(hào)殺手，引起了科研工作者的官方關(guān)注。鑒于DNA甲基化修飾在腫瘤中的重要作用， MethyCancer數(shù)據(jù)庫(kù)整合了DNA甲基化數(shù)據(jù)和基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，將癌癥與...
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MethHC: 整合了癌癥相關(guān)的甲基化與基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫(kù)
在MethHC數(shù)據(jù)庫(kù)中，提供了18種癌癥相關(guān)的DNA甲基化，microRNA表達(dá)譜和基因表達(dá)譜的數(shù)據(jù)，這里的數(shù)據(jù)來(lái)源于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)。同時(shí)采用線性回歸的方法計(jì)算甲基化和表達(dá)譜...
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NGS - Alignment 序列對(duì)比Introduction Resequencing 重測(cè)序 [NIBI] Resequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/probe/doc...
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用泊松分布解釋 NGS 測(cè)序數(shù)據(jù)的 duplication 問(wèn)題
tags： NGS duplication 不管從哪個(gè)角度看我們都希望測(cè)序儀產(chǎn)出的數(shù)據(jù)中 duplicate 率盡量低。怎樣降低 duplicate 率？ 構(gòu)建文庫(kù)時(shí)，核酸提...
