大家好，我叫楊俊偉，現(xiàn)就讀于中國農(nóng)業(yè)大學(xué)，在讀博士，主要從事生物信息學(xué)方面工作。<br><br>人生格言：Take pains, be perfect
IP屬地：湖北
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公眾號 R語言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注
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我很懶，但是我很可愛~~
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
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bamdst: bam文件深度統(tǒng)計
下載安裝 git clone https://github.com/shiquan/bamdst.gitcd bamdst/make 使用 先看看example/里面有些啥 ...
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主要關(guān)注于脊椎動物適應(yīng)性進(jìn)化與比較基因組學(xué)研究<br>簡書原賬號：WhyDoWeAge
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干貨 | 一文教會你如何采用Linux系統(tǒng)處理RNAseq測序數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)錄組是指細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和。轉(zhuǎn)錄組測序（Transcriptome sequencing）是基于Illumina HiSeq測序平臺檢測細(xì)胞內(nèi)所...
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組學(xué)工具合集
組學(xué)工具合集 整理了一些目前知道的與組學(xué)相關(guān)的工具，可能不全面，歡迎補充 基因組學(xué) 一代組裝 Celera Assembler: 最具代表性的工具 二代組裝 Minia SP...
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補充-1：基因是什么？在演化故事的敘述中，基因一直是故事的核心。而基因想法的提出、驗證，到最終的實物上的對應(yīng)，功能的明確，卻經(jīng)歷了漫長而曲折的過程。本次借著復(fù)習(xí)植物學(xué)的機會，我們來學(xué)習(xí)一下生物遺傳...
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學(xué)習(xí)了！！????
5 遺傳漂變和自然選擇
優(yōu)勢基因占領(lǐng)了整個種群的過程并不是只有自然選擇會決定其命運，遺傳漂變則給它的生命中增添了一抹沉浮的意味。和單獨受到選擇影響相比，兩個力量共同作用讓突變體能更快地提高頻率；不過...
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5 遺傳漂變和自然選擇優(yōu)勢基因占領(lǐng)了整個種群的過程并不是只有自然選擇會決定其命運，遺傳漂變則給它的生命中增添了一抹沉浮的意味。和單獨受到選擇影響相比，兩個力量共同作用讓突變體能更快地提高頻率；不過...
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生信老司機教你如何做基因組項目
作者：hony審稿：童蒙編輯：angelica 引言 轉(zhuǎn)眼間，從事生信工作已數(shù)年有余。在這期間，一直專注于基因組方面。項目經(jīng)驗較多，涉及的物種也從微生物擴展到動植物，但其中不...
