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    轉(zhuǎn)錄組分析進(jìn)階

    這是我聽孟浩巍知乎LiveB站鯪魚不會(huì)飛視頻(轉(zhuǎn)錄組分析進(jìn)階課程)里的筆記哦~ 本次知乎Live解決的問題: 轉(zhuǎn)錄組的建庫與質(zhì)量控制 人類基因組與轉(zhuǎn)錄組組成 轉(zhuǎn)錄組的2種建庫...

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    四. 基因組數(shù)據(jù)可視化(BWA, Minimap2, samtools and IGV)

    一. 簡介 在基因組數(shù)據(jù)分析過程中,我們可以將fastq,fasta,ONT等不同格式的數(shù)據(jù)mapping到參考基因組上,然后通過IGV進(jìn)行可視化,結(jié)合GFF3文件手工對感興...

  • hisat2比對轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)

    目前hisat2是最流行的轉(zhuǎn)錄組比對軟件,其比對速度快,且準(zhǔn)確度較高。具體使用方法如下:用到的軟件版本為hisat2-2.2.1,samtools-1.6 1. 構(gòu)建hisa...

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    RNAseq常規(guī)流程

    轉(zhuǎn)錄組分析是生信分析的一個(gè)基礎(chǔ)和常見的分析流程,一般從下機(jī)數(shù)據(jù)開始,經(jīng)過一系列的質(zhì)控,基因組比對,差異分析等過程得到實(shí)驗(yàn)組與對照組(或者腫瘤中的轉(zhuǎn)移組和原癌組)中差異表達(dá)的基...

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