mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系統(tǒng)的terminal! 盡管TCGA數(shù)據(jù)庫中已經(jīng)提供了大量的處理好的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù),但是無論是自身實(shí)驗(yàn)需要,還是從NCBI的GEO...
============================================寫在前面:可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做?[https://www.jians...
雖然簡單,但絕對首發(fā)……該給自己的系統(tǒng)發(fā)育構(gòu)建流程升級了,新版本軟件不僅速度快,而且對用戶友好! modeltest-ng 的速度是真的飛快!modeltest-ng 和 r...
IQ-TREE:最大似然法構(gòu)建精確、快速、靈活、廣泛的系統(tǒng)發(fā)育樹 IQ-TREE自2011年就已經(jīng)開發(fā)并開源,至今都有專業(yè)團(tuán)隊(duì)維護(hù),其名字來源于IQPNNI和TREE-PUZ...
基因組組裝完成后,或者是完成了草圖,就不可避免遇到一個問題,需要對基因組序列進(jìn)行注釋。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型,有三種策略: 從頭注釋(de novo prediction...
大愛洲更
「學(xué)轉(zhuǎn)錄組入門生信」第一周從環(huán)境配置開始我們第一周目標(biāo)有三個: 熟悉Linux環(huán)境登錄服務(wù)器Linux基本命令PATH的意義 學(xué)習(xí)conda管理環(huán)境如何在conda中添加channel如何用conda安裝和卸載軟件...
我們第一周目標(biāo)有三個: 熟悉Linux環(huán)境登錄服務(wù)器Linux基本命令PATH的意義 學(xué)習(xí)conda管理環(huán)境如何在conda中添加channel如何用conda安裝和卸載軟件...
持續(xù)更新ing.....最后更新時間:2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux的權(quán)限 權(quán)限: eg: 7=4+2+1 #代表w+r+x權(quán)限...
如果你的系統(tǒng)上沒有安裝使用命令安裝安裝firewalld 防火墻yum install firewalld 開啟服務(wù)systemctl start firewalld.ser...
有很多的生信軟件都可以通過conda安裝,省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件,conda一行命令就搞定了。前兩天有個胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
簡單的利用R語言繪制進(jìn)化樹(模仿筆記) 必備軟件:treeio,ggtree。需要首先安裝Bioconductor,官方網(wǎng)址:http://www.bioconductor....
PCA繪圖模仿筆記 PCA(Principal Component Analysis)是一種常用的數(shù)據(jù)分析方法。PCA通過線性變換將原始數(shù)據(jù)變換為一組各維度線性無關(guān)的...