大家好,本周我分享的文獻(xiàn)是一篇關(guān)于結(jié)合環(huán)境指標(biāo)解釋和預(yù)測(cè)作物表型的研究。 文章題目:An integrated framework reinstating the envir...
基本概念 Fst:群體間遺傳分化指數(shù),是種群分化和遺傳距離的一種衡量方法,分化指數(shù)越大,差異越大。適用于亞群體間多樣性的比較。用于衡量種群分化程度,取值從0到1,為0則認(rèn)為兩...
一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖:包鏈接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖,僅僅需要三列即可:a. 第...
前言 接下來我們要介紹的是 RNA-seq 數(shù)據(jù)的處理分析流程,根據(jù) RNA-seq 測(cè)序技術(shù)的不同,可以分為三種: short-read long-read direct ...
前言 近期分析了一部分小麥的全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),參考了網(wǎng)上許多流程,收獲良多,在此記錄一下 全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序基于PacBio單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)(SMRT cell),憑借超長(zhǎng)讀長(zhǎng)的...
對(duì)于非模式生物或者無(wú)參考基因組的項(xiàng)目,經(jīng)常需要進(jìn)行基因的功能注釋,而GO注釋是基因功能注釋的重要部分。有很多軟件能夠獲得GO注釋的信息,例如interproscan、eggn...