此教程無需R語言 Step 1 確定需要檢索的芯片 例如 GSE33006 Step 2 利用GEO2R分析差異基因 GEO2R https:/...
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此教程無需R語言 Step 1 確定需要檢索的芯片 例如 GSE33006 Step 2 利用GEO2R分析差異基因 GEO2R https:/...
前面幾期已經(jīng)完成了從TCGA表達(dá)譜/臨床數(shù)據(jù)下載處理整合,本次對(duì)樣本中的有annotations.txt的進(jìn)行分析處理 在之前下載的表達(dá)文件中,...
上期(#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表達(dá)譜及臨床數(shù)據(jù)下載?)介紹了使用TCGA 的API下載腫瘤表達(dá)譜及臨床數(shù)據(jù),本期來處理上期下載的...
前言 Canonical在4月發(fā)布了全新Ubuntu 18.04 LTS,新LTS(長期支持)將是一個(gè)專為個(gè)人、開發(fā)者及企業(yè)用戶所優(yōu)化的版本。在...
TCGA數(shù)據(jù),指癌癥測(cè)序數(shù)據(jù),TCGA的全稱為The Cancer Genome Atlas,癌癥基因組圖譜(TCGA)是美國國家癌癥研究所(N...
The cancer genome atlas(TCGA)數(shù)據(jù)庫儲(chǔ)存20多種癌癥的基因組數(shù)據(jù),作為生信喵少不了要下載上面的數(shù)據(jù)來分析。寫篇文章介...
前言 之前一直在用RTCGA包下載數(shù)據(jù),看著永不更新的數(shù)據(jù),心里總覺得怪怪的,于是下定決心重新學(xué)習(xí)一個(gè)好用的包——TCGAbiolinks。這個(gè)...
前面介紹了3種獲取TCGA數(shù)據(jù)的方法:使用TCGA2STAT、TCGAbiolinks、RTCGA。這里再介紹一個(gè)包:RTCGAToolbox包...
ROC曲線在我的記憶中,是在本科三年級(jí)的循證醫(yī)學(xué)課,預(yù)防醫(yī)學(xué)課上學(xué)過的,現(xiàn)在已經(jīng)很模糊了,但是好像需要用上,這一次來回顧下:ROC曲線(rece...