Part1 數(shù)據(jù)下載 先去Korean Personal Genome Project下載了編號(hào)為KPGP-00001的數(shù)據(jù)。 先說(shuō)一下KPG...
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WGS全流程的學(xué)習(xí)筆記
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該如何自學(xué)入門生物信息學(xué)
來(lái)源：解螺旋的礦工 http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxOTUxOTM0Nw==&mid=264979836...
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ANNOVAR | 注釋
標(biāo)簽（空格分隔）： annovar 注釋 [TOC] 介紹 參考鏈接 http://annovar.openbioinformatics.org...
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關(guān)于SNP的過(guò)濾（2）：如何使用vcftools進(jìn)行SNP過(guò)濾
繼續(xù)上一節(jié)課教程的下半節(jié)，繼續(xù)介紹一些其他過(guò)濾SNP的工具，歡迎大家跟著學(xué)習(xí)。 從現(xiàn)在開(kāi)始，過(guò)濾步驟假定vcf文件是由FreeBayes生成的。...
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ANNOVAR變異位點(diǎn)注釋軟件
歡迎關(guān)注"生信修煉手冊(cè)"！ ANNOVAR 是一款變異位點(diǎn)注釋軟件，提供了多方位的注釋功能，支持多個(gè)物種，是最受歡迎的注釋軟件之一。 支持的物種...
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HGVS制訂的變異位點(diǎn)命名規(guī)則
歡迎關(guān)注"生信修煉手冊(cè)"！ HGVS指定了一套完整的變異位點(diǎn)命名規(guī)則，統(tǒng)一的命名方便了學(xué)術(shù)溝通與交流。官網(wǎng)鏈接如下： https://www.h...
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如何學(xué)習(xí)生信什么是bioinformatician 如何你想成為一名生信人，那么至少你需要了解什么叫做生物信息學(xué)。否者，朝著錯(cuò)誤的方向再努力也是白費(fèi)勁。 什...
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GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上）前言 在前面的一系列WGS文章中，我講述了很多基因數(shù)據(jù)分析的來(lái)龍去脈，雖然許多同學(xué)覺(jué)得很有幫助，但是卻缺了一個(gè)重要的環(huán)節(jié)——沒(méi)有提供實(shí)際可用的數(shù)...
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關(guān)于SNP的過(guò)濾（1）：如何使用vcftools進(jìn)行SNP過(guò)濾
前言 很多關(guān)注我這個(gè)專題的朋友都在后臺(tái)留言，說(shuō)想了解更多關(guān)于SNP過(guò)濾的東西。是的，確實(shí)這是一個(gè)比較重要的問(wèn)題。第一，過(guò)濾到一些低質(zhì)量的SNP可...
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