decostand 是群落生態(tài)學(xué)中常用的工具包，提供了很多主流且高效的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化方法。 基本語法 標(biāo)準(zhǔn)化，和轉(zhuǎn)化相反，是求相對(duì)值，旨在降低數(shù)據(jù)之...
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R語言之?dāng)?shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化方法大全 -
三月week1文獻(xiàn)閱讀（上）:Pathway enrichment analysis and visualzation of omics data using g:Profiler,GSEA,C...三月week1文獻(xiàn)閱讀： Pathway enrichment analysis and visualzation of omics data ...
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背景：全基因組分析造血細(xì)胞中的DNA甲基化：WGBS的DNA甲基化分析
全基因組分析造血細(xì)胞中的DNA甲基化：WGBS的DNA甲基化分析 First Online: 23 July 2017 譯者注意：文章感覺什么都...
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教你在線繪制circos圖-簡(jiǎn)單！相信大家都聽說過circos圖，但是親自畫過的人可能就很少，這主要因?yàn)檐浖陌惭b和使用稍微有一點(diǎn)麻煩。其實(shí)，circos圖也是可以在線繪制的，這...
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GSEA筆記GSEA縮寫 GSEA的全稱是Gene Set Enrichment Analysis，中文翻譯就是基因集富集分析，最早提出GSEA的文章是下面...
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MAGMA (gene and gene-set level association test)1. 第一步，注釋 這一步，我們需要提供的是SNP位置文件，兩種二選一：1. .snp.loc文件（自己起的名字），三列按順序SNP ID、染色...
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R包genfu比較風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型（一）
研究需要，不得不斷的學(xué)習(xí)新的軟件包，R的突出特點(diǎn)即在于開源，和眾多的軟件包，其學(xué)習(xí)的難點(diǎn)也在于需要包太多，每用新的包都需要學(xué)習(xí)，了解軟件的使用參...
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PCA分析？Emm，快速上手與出圖！寫在前面 PCA，principle component analysis，翻譯為中文，即常說的主成分分析。其為相對(duì)經(jīng)典的降維算法，對(duì)具體計(jì)算邏...
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「文獻(xiàn)02」esATAC: 一個(gè)ATAC-seq分析的R包日期：2019年1月13日——2019-Week2分類：「工具」題目：esATAC: An Easy-to-use Systematic pip...
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ATAC-Seq 數(shù)據(jù)分析（上）背景： 染色質(zhì)和染色體的結(jié)構(gòu)和功能 每一條染色單體由單個(gè)線性DNA分子組成。細(xì)胞核中的DNA是經(jīng)過高度有序的包裝，否則就是一團(tuán)亂麻，不利于DNA...
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