傳說中的 “bio生物信息” 首席編輯
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2019-10-22 R語言Seurat包下游分析-1下游分析 cellranger count 計(jì)算的結(jié)果只能作為錯(cuò)略觀測(cè)的結(jié)果，如果需要進(jìn)一步分析聚類細(xì)胞，還需要進(jìn)行下游分析，這里使用官方推薦 R 包（Seurat 3.0）...
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FPKM數(shù)據(jù)該怎么分析？
前天同事幫領(lǐng)導(dǎo)寫基金，看文獻(xiàn)找思路，突然問我能不能幫她分析一下數(shù)據(jù)，我看了一下數(shù)據(jù)是FPKM的文件。第一反應(yīng)是可以。我就試試了一下。 1.數(shù)據(jù)下載 2、差異基因分析 3.如何...
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conda操作-1| conda鏡像源查看、國(guó)內(nèi)鏡像添加與刪除
1、鏡像源查看 2、國(guó)內(nèi)第三方源添加 3、刪除源 4、源報(bào)錯(cuò)處理 報(bào)錯(cuò)： 處理：查看并刪除報(bào)錯(cuò)的源
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單細(xì)胞測(cè)序（scRNA-seq）通關(guān)||數(shù)據(jù)處理必知必會(huì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列教程 sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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scRNA-seq擬時(shí)分析 || Monocle2 踩坑教程擬時(shí)（pseudotime）分析，又稱細(xì)胞軌跡（cell trajectory）分析，通過擬時(shí)分析可以推斷出發(fā)育過程細(xì)胞的分化軌跡或細(xì)胞亞型的演化過程，在發(fā)育相關(guān)研究中使用頻...
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軌跡推斷、擬時(shí)序分析trajectory inference (TI) methods, also called pseudotime analysis 在發(fā)育、受到刺激等生命過程中，細(xì)胞無時(shí)不...
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簡(jiǎn)單理解RNA-Seq今天就當(dāng)一個(gè)小故事看吧，看了statQuest，感覺講的很棒，于是分享給大家原版視頻后臺(tái)回復(fù)“RNAseq”??花花今天效率太低寫不完推送，于是我從晚上10點(diǎn)半開始幫她，有點(diǎn)緊...
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關(guān)注科研生態(tài)，推廣科學(xué)成果，解密生命奧妙，歡迎關(guān)注公眾號(hào)：生信風(fēng)暴
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上海嘉因生物科技有限公司，表觀遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)領(lǐng)跑者，上海市高新技術(shù)企業(yè)，博士后流動(dòng)站?？蒲蟹?wù)領(lǐng)域主要產(chǎn)品線：CUT&Tag/ChIP-seq，ATAC-seq，1微克MeRIP-seq， eccDNA-seq（環(huán)狀DNA測(cè)序），單細(xì)胞ATAC-seq和單細(xì)胞RNA-seq。在臨床檢測(cè)領(lǐng)域，團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一整套針對(duì)cfDNA甲基化的實(shí)驗(yàn)檢測(cè)技術(shù)和數(shù)據(jù)分析技術(shù)，相關(guān)應(yīng)用產(chǎn)品正在臨床實(shí)驗(yàn)階段。
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搞科研，什么都不配，進(jìn)了實(shí)驗(yàn)室我就是王，出了實(shí)驗(yàn)室就是舔??一枚，經(jīng)受著社會(huì)在身上不斷的摩擦，反抗不了，只能學(xué)著享受。
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