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    2019-10-22 R語言Seurat包下游分析-1

    下游分析 cellranger count 計(jì)算的結(jié)果只能作為錯略觀測的結(jié)果,如果需要進(jìn)一步分析聚類細(xì)胞,還需要進(jìn)行下游分析,這里使用官方推薦 R 包(Seurat 3.0)...

  • FPKM數(shù)據(jù)該怎么分析?

    前天同事幫領(lǐng)導(dǎo)寫基金,看文獻(xiàn)找思路,突然問我能不能幫她分析一下數(shù)據(jù),我看了一下數(shù)據(jù)是FPKM的文件。第一反應(yīng)是可以。我就試試了一下。 1.數(shù)據(jù)下載 2、差異基因分析 3.如何...

  • conda操作-1| conda鏡像源查看、國內(nèi)鏡像添加與刪除

    1、鏡像源查看 2、國內(nèi)第三方源添加 3、刪除源 4、源報錯處理 報錯: 處理:查看并刪除報錯的源

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    單細(xì)胞測序(scRNA-seq)通關(guān)||數(shù)據(jù)處理必知必會

    單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列教程 sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...

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    scRNA-seq擬時分析 || Monocle2 踩坑教程

    擬時(pseudotime)分析,又稱細(xì)胞軌跡(cell trajectory)分析,通過擬時分析可以推斷出發(fā)育過程細(xì)胞的分化軌跡或細(xì)胞亞型的演化過程,在發(fā)育相關(guān)研究中使用頻...

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    軌跡推斷、擬時序分析

    trajectory inference (TI) methods, also called pseudotime analysis 在發(fā)育、受到刺激等生命過程中,細(xì)胞無時不...

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    簡單理解RNA-Seq

    今天就當(dāng)一個小故事看吧,看了statQuest,感覺講的很棒,于是分享給大家原版視頻后臺回復(fù)“RNAseq”??花花今天效率太低寫不完推送,于是我從晚上10點(diǎn)半開始幫她,有點(diǎn)緊...

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