WGCNA原理和分析流程[http://www.itdecent.cn/p/9331eb5377d1] 單細(xì)胞WGCNA分析方法+隨機(jī)森林[https://www.jian...
今天,和大家分享一篇生信文章的解讀與復(fù)現(xiàn)——隨機(jī)森林與人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)聯(lián)合診斷心衰模型的構(gòu)建與分析。 Part1文獻(xiàn)解讀 1摘要 心力衰竭是一個全球性的健康問題,影響到全世界約 ...
本教程根據(jù)PlantTech的WGCNA課程編寫,課程還是不錯的,所以將該課程給大家分享一下。 WGCNA筆記第一彈 WGCNA分析原理 WGCNA應(yīng)用場景 WGCNA分析實...
WGCNA筆記第三彈 WGCNA分析原理 WGCNA應(yīng)用場景 WGCNA分析實踐 本代碼借鑒了生信技能樹的WGCNA教程以及PlanTech的WGCNA課程編寫,轉(zhuǎn)載請注明出...
題目出自【生信技能樹】公眾號文章:2011年的表達(dá)芯片分析和2019年的區(qū)別要求:走GEO標(biāo)準(zhǔn)分析流程分析GSE27447 代碼主要復(fù)制于Jimmy大佬的github:htt...
放在最前面的參考鏈接:給學(xué)徒的ATAC-seq數(shù)據(jù)實戰(zhàn)(附上收費視頻) 數(shù)據(jù)來源的文章: The landscape of accessible chromatin in m...
寫在前面 很榮幸參加生信技能樹全國巡講-第一站-重慶站的RNA-seq線下培訓(xùn)課程。以下為線下課結(jié)合線上課所做的筆記,希望能幫到你。 一些小練習(xí)題 下面開始RNA-seq流程...
有很多的生信軟件都可以通過conda安裝,省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件,conda一行命令就搞定了。前兩天有個胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
我們展示如何從其他現(xiàn)有的單細(xì)胞分析工具包(包括Seurat和Scanpy)中提取CellChat輸入文件。 CellChat需要兩個輸入文件:一個是細(xì)胞的基因表達(dá)數(shù)據(jù),另一個...