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發(fā)簡信
IP屬地：陜西
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有重復樣本RNA-seq count數(shù)據(jù)分析寫在前面： 分析之前需要兩個文件文件1：countMatrix.txt數(shù)據(jù)，其中存儲著實驗組與對照組的基因表達的count值（行是基因，列是樣本名）同時注意如果數(shù)據(jù)里面有缺失...
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R語言處理CCK8或MTT數(shù)據(jù)，一步繪制生長曲線CCK8數(shù)據(jù)主要是統(tǒng)計OD450的吸收值，一般的數(shù)據(jù)形式如下，保存為csv格式 加個P值，調整坐標，適當美化 首先預統(tǒng)計看下結果 結果還不錯，添加顯著標志 細節(jié)地方AI處理一...
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maftools畫瀑布圖（oncoplot）什么是瀑布圖 這種由麥肯錫顧問公司所獨創(chuàng)的圖表類型，因為形似瀑布流水而被稱之為瀑布圖( Waterfall Plot)。瀑布圖具有自上而下的流暢效果，也可以稱為階梯圖（Cas...
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第7篇：用Y叔的ChIPseeker對peaks進行注釋和可視化上一步驟（第6篇：重復樣本的處理——IDR）用IDR對重復樣本peaks的一致性進行了評估，同時得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr，接下來就是對p...
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CRISPR-Cas9基因編輯技術簡介CRISPR-Cas9是繼ZFN、TALENs等基因編輯技術推出后的第三代基因編輯技術，短短幾年內,CRISPR-Cas9技術風靡全球, 成為現(xiàn)有基因編輯和基因修飾里面效率最...
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常見實驗室小鼠的命名規(guī)則~
中科聯(lián)盟，隨時隨地預約儀器。 根據(jù)遺傳特點的不同，實驗小鼠可分為三大類： 近交系、封閉群和雜交群 。 參考標準：中國國家質量監(jiān)督檢驗檢疫總局發(fā)布的〖實驗動物 哺乳類實驗動物的...
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本號停更
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你好，你這樣兩兩之間不是事后比較，仍是默認的Wilcoxon檢驗
R使用筆記：ggplot2 & ggpubr 給boxplot添加significance levels
本次筆記內容：用ggpubr的stat_compare_means()給boxplot加上significant labels編寫函數(shù)選擇P值小于某一值的pairs，并只在圖...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類熱圖 ComplexHeatmap(一)前言 使用 pheatmap 已經(jīng)能夠繪制滿足大多數(shù)要求的聚類熱圖了。 受 pheatmap 包的啟發(fā)，ComplexHeatmap 提供了對熱圖更多更靈活的控制，如多數(shù)據(jù)熱...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— circlize 復雜圖形與圖例復雜圖像 我們可以使用一些簡單的圖形對象，將它們組合起來，繪制成各種復雜的圖形 1. 圓形柱狀圖 我們介紹過了各種柱狀圖/條形圖的繪制，如堆積型、并列型，還有徑向柱狀圖，現(xiàn)在...
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使用oncoPrint繪制瀑布圖殺殺生信分析中，我們在全基因組測序后會獲得分子突變譜信息，如何直觀地將各種疾病分子亞型下的基因突變特征，以及分子共突變/互斥突變的特征展示出來呢？ 我們可以使用R語言中一個非...
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maftools包計算TMB值腫瘤突變負荷(TMB)計算 原文出處：https://mp.weixin.qq.com/s/xuwiZWl8hTVzU2m39dIfxg[https://mp.weixin....
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R數(shù)據(jù)可視化1: 火山圖拖延癥讓我一直疲于整理qiime2的分析過程。而且手上暫時也沒有相應的16S數(shù)據(jù)要分析，所以打算整理整理R的畫圖腳本。而且總是百度一些畫圖細節(jié)讓我“厭倦”了，覺得自己急需整理...
