歡迎關(guān)注公眾號(hào) “生信交流平臺(tái)”
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
-
-
有重復(fù)樣本RNA-seq count數(shù)據(jù)分析寫在前面： 分析之前需要兩個(gè)文件文件1：countMatrix.txt數(shù)據(jù)，其中存儲(chǔ)著實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的基因表達(dá)的count值（行是基因，列是樣本名）同時(shí)注意如果數(shù)據(jù)里面有缺失...
-
R語(yǔ)言處理CCK8或MTT數(shù)據(jù)，一步繪制生長(zhǎng)曲線CCK8數(shù)據(jù)主要是統(tǒng)計(jì)OD450的吸收值，一般的數(shù)據(jù)形式如下，保存為csv格式 加個(gè)P值，調(diào)整坐標(biāo)，適當(dāng)美化 首先預(yù)統(tǒng)計(jì)看下結(jié)果 結(jié)果還不錯(cuò)，添加顯著標(biāo)志 細(xì)節(jié)地方AI處理一...
-
maftools畫瀑布圖（oncoplot）什么是瀑布圖 這種由麥肯錫顧問(wèn)公司所獨(dú)創(chuàng)的圖表類型，因?yàn)樾嗡破俨剂魉环Q之為瀑布圖( Waterfall Plot)。瀑布圖具有自上而下的流暢效果，也可以稱為階梯圖（Cas...
-
第7篇：用Y叔的ChIPseeker對(duì)peaks進(jìn)行注釋和可視化上一步驟（第6篇：重復(fù)樣本的處理——IDR）用IDR對(duì)重復(fù)樣本peaks的一致性進(jìn)行了評(píng)估，同時(shí)得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr，接下來(lái)就是對(duì)p...
-
CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)簡(jiǎn)介CRISPR-Cas9是繼ZFN、TALENs等基因編輯技術(shù)推出后的第三代基因編輯技術(shù)，短短幾年內(nèi),CRISPR-Cas9技術(shù)風(fēng)靡全球, 成為現(xiàn)有基因編輯和基因修飾里面效率最...
-
常見實(shí)驗(yàn)室小鼠的命名規(guī)則~
中科聯(lián)盟，隨時(shí)隨地預(yù)約儀器。 根據(jù)遺傳特點(diǎn)的不同，實(shí)驗(yàn)小鼠可分為三大類： 近交系、封閉群和雜交群 。 參考標(biāo)準(zhǔn)：中國(guó)國(guó)家質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)檢疫總局發(fā)布的〖實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 哺乳類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的...
-
基因工程鼠概述1. 轉(zhuǎn)基因小鼠 Tg表示轉(zhuǎn)基因（transgene），細(xì)分如下：TgH：同源重組，TgR：經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄病毒載體感染的插入，TgN： 非同源插入。轉(zhuǎn)入的基因放在圓括號(hào)中，不用斜體...
-
不看私信<br>看不到的文章是被簡(jiǎn)書鎖了
-
本號(hào)停更
-
你好，你這樣兩兩之間不是事后比較，仍是默認(rèn)的Wilcoxon檢驗(yàn)
R使用筆記：ggplot2 & ggpubr 給boxplot添加significance levels
本次筆記內(nèi)容：用ggpubr的stat_compare_means()給boxplot加上significant labels編寫函數(shù)選擇P值小于某一值的pairs，并只在圖...
-
生物信息學(xué)專業(yè)<br>公眾號(hào)：生信學(xué)習(xí)手冊(cè)
-
R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類熱圖 ComplexHeatmap(一)前言 使用 pheatmap 已經(jīng)能夠繪制滿足大多數(shù)要求的聚類熱圖了。 受 pheatmap 包的啟發(fā)，ComplexHeatmap 提供了對(duì)熱圖更多更靈活的控制，如多數(shù)據(jù)熱...
-
R 數(shù)據(jù)可視化 —— circlize 復(fù)雜圖形與圖例復(fù)雜圖像 我們可以使用一些簡(jiǎn)單的圖形對(duì)象，將它們組合起來(lái)，繪制成各種復(fù)雜的圖形 1. 圓形柱狀圖 我們介紹過(guò)了各種柱狀圖/條形圖的繪制，如堆積型、并列型，還有徑向柱狀圖，現(xiàn)在...
-
使用oncoPrint繪制瀑布圖殺殺生信分析中，我們?cè)谌蚪M測(cè)序后會(huì)獲得分子突變譜信息，如何直觀地將各種疾病分子亞型下的基因突變特征，以及分子共突變/互斥突變的特征展示出來(lái)呢？ 我們可以使用R語(yǔ)言中一個(gè)非...
-
-
CoIP結(jié)果查看
CoIP的原理圖 文獻(xiàn)信息： Abe, T., et al. (2017). "Germ-Cell-Specific Inflammasome Component NLRP1...
-
擬時(shí)序分析簡(jiǎn)要內(nèi)容--擬時(shí)序分析的定義--結(jié)果解讀--------做出結(jié)果（cluster、state）--------確定起始點(diǎn)--------做start····end的圖（并且映...
-
maftools包計(jì)算TMB值腫瘤突變負(fù)荷(TMB)計(jì)算 原文出處：https://mp.weixin.qq.com/s/xuwiZWl8hTVzU2m39dIfxg[https://mp.weixin....
-
R數(shù)據(jù)可視化1: 火山圖拖延癥讓我一直疲于整理qiime2的分析過(guò)程。而且手上暫時(shí)也沒有相應(yīng)的16S數(shù)據(jù)要分析，所以打算整理整理R的畫圖腳本。而且總是百度一些畫圖細(xì)節(jié)讓我“厭倦”了，覺得自己急需整理...
