TPM是RNAseq測(cè)序結(jié)果里很好的歸一化表達(dá)矩陣，以前都是FPKM，但目前TPM才是主流，很多測(cè)序公司也開始用TPM作為基因定量單位進(jìn)行分析了，基因表達(dá)分布、相關(guān)性系數(shù)和主...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：香港
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有了TPM，怎么做基因表達(dá)分析、相關(guān)性分析和主成分分析 -
石河子大學(xué)第一附屬醫(yī)院泌尿外科副主任醫(yī)師
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周運(yùn)來，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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不斷學(xué)習(xí)，不斷忘記，不斷回顧，不斷進(jìn)步，這便是凡人的學(xué)習(xí)方式,或謂曰：Attention is all you need,but learning is all your attention.
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ChIP-seq數(shù)據(jù)分析學(xué)習(xí)資源總結(jié)首先這個(gè)名字要寫對(duì)：ChIP-seq，有很多論文沒注意大小寫，其實(shí)沒理解每個(gè)字母所代表的含義。ChIP-seq大致原理看一看： Figure 1: Workflow of a...
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ChIP實(shí)驗(yàn)操作以及Chip-seq數(shù)據(jù)分析ChIP（Chromatin immunoprecitation）是研究體內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)相互作用的重要工具。 “染色質(zhì)”就是由“組蛋白和DNA”組成的物質(zhì)；“免疫”就是通過...
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2020-06-23 Chip-seq 數(shù)據(jù)分析（1）1.參考文獻(xiàn) Brookes, E. et al. Polycomb associates genome-wide with a specific RNA polymeras...
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NBIS系列單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)（五）：基因差異表達(dá)分析第五節(jié)：基因差異表達(dá)分析 在本節(jié)教程中，我們將介紹基因差異表達(dá)分析的相關(guān)知識(shí)。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中，差異表達(dá)分析可以具有多種功能，例如鑒定細(xì)胞群的標(biāo)記基因，以及跨條件（健康與對(duì)...
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單細(xì)胞測(cè)序細(xì)胞類型注釋輔助數(shù)據(jù)庫(kù)大全
在拿到單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)后，非常關(guān)鍵的一步是做細(xì)胞類型鑒定，如果這一步不準(zhǔn)確，那么后續(xù)所有分析都將不可靠。這需要有比較準(zhǔn)確而合適的marker基因列表，然而大部分情況下marke...
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一起學(xué)習(xí)單細(xì)胞測(cè)序知識(shí)
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這個(gè)專題主要介紹高通量測(cè)序技術(shù)在科研及臨床方面的應(yīng)用方向，比如RNAseq、單細(xì)胞測(cè)序等
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