TPM是RNAseq測序結果里很好的歸一化表達矩陣,以前都是FPKM,但目前TPM才是主流,很多測序公司也開始用TPM作為基因定量單位進行分析了,基因表達分布、相關性系數和主...
TPM是RNAseq測序結果里很好的歸一化表達矩陣,以前都是FPKM,但目前TPM才是主流,很多測序公司也開始用TPM作為基因定量單位進行分析了,基因表達分布、相關性系數和主...
首先這個名字要寫對:ChIP-seq,有很多論文沒注意大小寫,其實沒理解每個字母所代表的含義。ChIP-seq大致原理看一看: Figure 1: Workflow of a...
ChIP(Chromatin immunoprecitation)是研究體內DNA與蛋白質相互作用的重要工具。 “染色質”就是由“組蛋白和DNA”組成的物質;“免疫”就是通過...
1.參考文獻 Brookes, E. et al. Polycomb associates genome-wide with a specific RNA polymeras...
第五節(jié):基因差異表達分析 在本節(jié)教程中,我們將介紹基因差異表達分析的相關知識。在單細胞數據分析中,差異表達分析可以具有多種功能,例如鑒定細胞群的標記基因,以及跨條件(健康與對...
在拿到單細胞測序數據后,非常關鍵的一步是做細胞類型鑒定,如果這一步不準確,那么后續(xù)所有分析都將不可靠。這需要有比較準確而合適的marker基因列表,然而大部分情況下marke...