各種生存分析-傻傻分不清 作者：白介素2 OS 總體生存期： Overall Survival 定義： 結局指標是死亡時間，這個死亡是任何原因導致的死亡都算進去，只關心是否死...
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OS/PFS/DFS/DSS各種生存指標傻傻分不清
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ggplot2 中的 position_dodge命令
ggplot2 軟件包中 position_dodge 命令的說明文檔如下：width: Dodging width, when different to the width...
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R語言基礎入門(4) mutate函數創(chuàng)建新列
今天繼續(xù)介紹dplyr包中的重要函數mutate，其基本功能為創(chuàng)建新列；mutate中的選項幾乎是無窮無盡的，可以通過各種函數之間的組合來對數據集做任意的處理，下面通過具體的...
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根據bam文件推測捕獲區(qū)間（bed）/獲取全部基因（exon）的區(qū)間1，將UCSC的refFlat.txt轉換成bed文件 基因全長bed refFlat.txt文件示例： hg19.genes.bed文件示例： 注：老版本的cnvkit自帶...
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彼得潘之島：天堂還是地獄？今天跟大家分享的《喂，出來》中的故事是：彼得潘之島。不知道上世紀六七十年代的島國是否也出現了對“應試教育”的反省，所以作者才會寫下這則故事？ 教育的目的絕不因該是讓每個人都成...
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org.Hs.eg.db 包的使用jimmy布置的個R語言中級作業(yè)中提到了幾個R包，我查找了Bioconductor中org.Hs.eg.db包的使用說明書，為了自己更好的理解和應用，做了以下筆記。 首先了解...
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COSMIC數據庫介紹——癌癥研究者必看這是Sanger 研究所 2018 年 發(fā)表的在《Nucleic Acids Research》上的關于COSMIC v86 新版本的一篇文章，對 COSMIC 數據庫功能和...
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常用實驗設計方法（DOE）介紹實驗設計介紹 Design Of Experiments(DOE) 進行實驗設計的目的： ?快速達到最好的結果 ?省略不必要的試驗 ?給最好的精確結果 ?進展沒有失敗 ?建立...
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Python數據可視化（七）：箱線圖繪制
使用seaborn包繪制箱線圖[#%E4%BD%BF%E7%94%A8seaborn%E5%8C%85%E7%BB%98%E5%88%B6%E7%AE%B1%E7%BA%BF...
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卡方檢驗、T檢驗+F檢驗、方差分析、Z檢驗1、卡方檢驗： 卡方檢驗是用途非常廣的以卡方分布（深入淺出統(tǒng)計學有講）為基礎的一種假設檢驗方法，它屬于非參數檢驗的范疇，主要是比較兩個及兩個以上樣本率( 構成比）以及兩個分類...
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非參數檢驗：Wilcoxon檢驗引言 Wilcoxon檢驗（也被稱為Mann-Withney-Wilcoxon檢驗）是一種非參數檢驗，意味著它不依賴于屬于任何特定參數的概率分布家族的數據。非參數檢驗的目標與...
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生信課程筆記7-基因區(qū)間和注釋資源Summary 1.Bioconductor注釋資源 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 人類的全基因組序列TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38...
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機器學習基礎（1）- ROC曲線理解本文用于理解ROC曲線的定義，繪制過程及其應用實現，主要用于自我溫習回顧基礎 基本目錄如下： 什么是ROC曲線？1.1 ROC曲線的歷史1.2 ROC曲線的定義1.3 ROC...
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什么是協(xié)變量Covariate？如何控制隨機對照研究中協(xié)變量的影響
初學者非常迷惑，很多英文SCI經常出現Covariate。什么是Covariate？它在統(tǒng)計分析中扮演什么角色？如何控制它的不良影響呢？ 協(xié)變量是指不同干預措施前，研究者預計...
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三代變異檢測操作說明-DeepVariant
作者：Charon審稿：童蒙編輯：amethyst 眾所周知，三代測序的單堿基測序錯誤率遠遠高于二代測序，PB的單堿基錯誤率有10-15%，而ONT也有5-20%[1]，那么...
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生存分析（Survival analysis）的總結整理
生存分析(Survival analysis)是指根據試驗或調查得到的數據對生物或人的生存時間進行分析和推斷，研究生存時間和結局與眾多影響因素間關系及其程度大小的方法，也稱生...
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利用sklearn做ROC曲線注意：畫pr曲線可以參考http://www.cnblogs.com/aquastone/p/random-classifier.html 對matrix或array型數據做...
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16型人格性吸引力大揭秘！
關注MBTI下午茶，獲取更多有趣的MBTI內容。 無論你在網上說自己多么喜歡哪些人格，無論網上的大家在嗑哪些mbti的cp，都是網絡情緣一線牽！ 但要說性吸引力的話，還是得在...
