各種生存分析-傻傻分不清 作者：白介素2 OS 總體生存期： Overall Survival 定義： 結(jié)局指標是死亡時間，這個死亡是任何原因?qū)е碌乃劳龆妓氵M去，只關心是否死...
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OS/PFS/DFS/DSS各種生存指標傻傻分不清
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ggplot2 中的 position_dodge命令
ggplot2 軟件包中 position_dodge 命令的說明文檔如下：width: Dodging width, when different to the width...
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R語言基礎入門(4) mutate函數(shù)創(chuàng)建新列
今天繼續(xù)介紹dplyr包中的重要函數(shù)mutate，其基本功能為創(chuàng)建新列；mutate中的選項幾乎是無窮無盡的，可以通過各種函數(shù)之間的組合來對數(shù)據(jù)集做任意的處理，下面通過具體的...
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根據(jù)bam文件推測捕獲區(qū)間（bed）/獲取全部基因（exon）的區(qū)間1，將UCSC的refFlat.txt轉(zhuǎn)換成bed文件 基因全長bed refFlat.txt文件示例： hg19.genes.bed文件示例： 注：老版本的cnvkit自帶...
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彼得潘之島：天堂還是地獄？今天跟大家分享的《喂，出來》中的故事是：彼得潘之島。不知道上世紀六七十年代的島國是否也出現(xiàn)了對“應試教育”的反省，所以作者才會寫下這則故事？ 教育的目的絕不因該是讓每個人都成...
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org.Hs.eg.db 包的使用jimmy布置的個R語言中級作業(yè)中提到了幾個R包，我查找了Bioconductor中org.Hs.eg.db包的使用說明書，為了自己更好的理解和應用，做了以下筆記。 首先了解...
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COSMIC數(shù)據(jù)庫介紹——癌癥研究者必看這是Sanger 研究所 2018 年 發(fā)表的在《Nucleic Acids Research》上的關于COSMIC v86 新版本的一篇文章，對 COSMIC 數(shù)據(jù)庫功能和...
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常用實驗設計方法（DOE）介紹實驗設計介紹 Design Of Experiments(DOE) 進行實驗設計的目的： ?快速達到最好的結(jié)果 ?省略不必要的試驗 ?給最好的精確結(jié)果 ?進展沒有失敗 ?建立...
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Python數(shù)據(jù)可視化（七）：箱線圖繪制
使用seaborn包繪制箱線圖[#%E4%BD%BF%E7%94%A8seaborn%E5%8C%85%E7%BB%98%E5%88%B6%E7%AE%B1%E7%BA%BF...
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卡方檢驗、T檢驗+F檢驗、方差分析、Z檢驗1、卡方檢驗： 卡方檢驗是用途非常廣的以卡方分布（深入淺出統(tǒng)計學有講）為基礎的一種假設檢驗方法，它屬于非參數(shù)檢驗的范疇，主要是比較兩個及兩個以上樣本率( 構(gòu)成比）以及兩個分類...
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非參數(shù)檢驗：Wilcoxon檢驗引言 Wilcoxon檢驗（也被稱為Mann-Withney-Wilcoxon檢驗）是一種非參數(shù)檢驗，意味著它不依賴于屬于任何特定參數(shù)的概率分布家族的數(shù)據(jù)。非參數(shù)檢驗的目標與...
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生信課程筆記7-基因區(qū)間和注釋資源Summary 1.Bioconductor注釋資源 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 人類的全基因組序列TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38...
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機器學習基礎（1）- ROC曲線理解本文用于理解ROC曲線的定義，繪制過程及其應用實現(xiàn)，主要用于自我溫習回顧基礎 基本目錄如下： 什么是ROC曲線？1.1 ROC曲線的歷史1.2 ROC曲線的定義1.3 ROC...
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什么是協(xié)變量Covariate？如何控制隨機對照研究中協(xié)變量的影響
初學者非常迷惑，很多英文SCI經(jīng)常出現(xiàn)Covariate。什么是Covariate？它在統(tǒng)計分析中扮演什么角色？如何控制它的不良影響呢？ 協(xié)變量是指不同干預措施前，研究者預計...
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三代變異檢測操作說明-DeepVariant
作者：Charon審稿：童蒙編輯：amethyst 眾所周知，三代測序的單堿基測序錯誤率遠遠高于二代測序，PB的單堿基錯誤率有10-15%，而ONT也有5-20%[1]，那么...
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生存分析（Survival analysis）的總結(jié)整理
生存分析(Survival analysis)是指根據(jù)試驗或調(diào)查得到的數(shù)據(jù)對生物或人的生存時間進行分析和推斷，研究生存時間和結(jié)局與眾多影響因素間關系及其程度大小的方法，也稱生...
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利用sklearn做ROC曲線注意：畫pr曲線可以參考http://www.cnblogs.com/aquastone/p/random-classifier.html 對matrix或array型數(shù)據(jù)做...
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16型人格性吸引力大揭秘！
關注MBTI下午茶，獲取更多有趣的MBTI內(nèi)容。 無論你在網(wǎng)上說自己多么喜歡哪些人格，無論網(wǎng)上的大家在嗑哪些mbti的cp，都是網(wǎng)絡情緣一線牽！ 但要說性吸引力的話，還是得在...
