各種生存分析-傻傻分不清 作者：白介素2 OS 總體生存期： Overall Survival 定義： 結(jié)局指標(biāo)是死亡時(shí)間，這個(gè)死亡是任何原因?qū)е碌乃劳龆妓氵M(jìn)去，只關(guān)心是否死...
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OS/PFS/DFS/DSS各種生存指標(biāo)傻傻分不清
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ggplot2 中的 position_dodge命令
ggplot2 軟件包中 position_dodge 命令的說明文檔如下：width: Dodging width, when different to the width...
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R語言基礎(chǔ)入門(4) mutate函數(shù)創(chuàng)建新列
今天繼續(xù)介紹dplyr包中的重要函數(shù)mutate，其基本功能為創(chuàng)建新列；mutate中的選項(xiàng)幾乎是無窮無盡的，可以通過各種函數(shù)之間的組合來對(duì)數(shù)據(jù)集做任意的處理，下面通過具體的...
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根據(jù)bam文件推測捕獲區(qū)間（bed）/獲取全部基因（exon）的區(qū)間1，將UCSC的refFlat.txt轉(zhuǎn)換成bed文件 基因全長bed refFlat.txt文件示例： hg19.genes.bed文件示例： 注：老版本的cnvkit自帶...
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小紅書超詳細(xì)分析
（請勿轉(zhuǎn)載） 1.行業(yè)概述 1.1背景 隨著國內(nèi)經(jīng)濟(jì)的持續(xù)發(fā)展，逐漸擴(kuò)大中的新一代中產(chǎn)階級(jí)人群的經(jīng)濟(jì)條件已經(jīng)達(dá)到了新的高度。同時(shí)，在新的文化和市場環(huán)境下成長起來的他們對(duì)生活方...
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彼得潘之島：天堂還是地獄？今天跟大家分享的《喂，出來》中的故事是：彼得潘之島。不知道上世紀(jì)六七十年代的島國是否也出現(xiàn)了對(duì)“應(yīng)試教育”的反省，所以作者才會(huì)寫下這則故事？ 教育的目的絕不因該是讓每個(gè)人都成...
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org.Hs.eg.db 包的使用jimmy布置的個(gè)R語言中級(jí)作業(yè)中提到了幾個(gè)R包，我查找了Bioconductor中org.Hs.eg.db包的使用說明書，為了自己更好的理解和應(yīng)用，做了以下筆記。 首先了解...
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COSMIC數(shù)據(jù)庫介紹——癌癥研究者必看這是Sanger 研究所 2018 年 發(fā)表的在《Nucleic Acids Research》上的關(guān)于COSMIC v86 新版本的一篇文章，對(duì) COSMIC 數(shù)據(jù)庫功能和...
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常用實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方法（DOE）介紹實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)介紹 Design Of Experiments(DOE) 進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的目的： ?快速達(dá)到最好的結(jié)果 ?省略不必要的試驗(yàn) ?給最好的精確結(jié)果 ?進(jìn)展沒有失敗 ?建立...
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Python數(shù)據(jù)可視化（七）：箱線圖繪制
使用seaborn包繪制箱線圖[#%E4%BD%BF%E7%94%A8seaborn%E5%8C%85%E7%BB%98%E5%88%B6%E7%AE%B1%E7%BA%BF...
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卡方檢驗(yàn)、T檢驗(yàn)+F檢驗(yàn)、方差分析、Z檢驗(yàn)1、卡方檢驗(yàn)： 卡方檢驗(yàn)是用途非常廣的以卡方分布（深入淺出統(tǒng)計(jì)學(xué)有講）為基礎(chǔ)的一種假設(shè)檢驗(yàn)方法，它屬于非參數(shù)檢驗(yàn)的范疇，主要是比較兩個(gè)及兩個(gè)以上樣本率( 構(gòu)成比）以及兩個(gè)分類...
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非參數(shù)檢驗(yàn)：Wilcoxon檢驗(yàn)引言 Wilcoxon檢驗(yàn)（也被稱為Mann-Withney-Wilcoxon檢驗(yàn)）是一種非參數(shù)檢驗(yàn)，意味著它不依賴于屬于任何特定參數(shù)的概率分布家族的數(shù)據(jù)。非參數(shù)檢驗(yàn)的目標(biāo)與...
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生信課程筆記7-基因區(qū)間和注釋資源Summary 1.Bioconductor注釋資源 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 人類的全基因組序列TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38...
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機(jī)器學(xué)習(xí)基礎(chǔ)（1）- ROC曲線理解本文用于理解ROC曲線的定義，繪制過程及其應(yīng)用實(shí)現(xiàn)，主要用于自我溫習(xí)回顧基礎(chǔ) 基本目錄如下： 什么是ROC曲線？1.1 ROC曲線的歷史1.2 ROC曲線的定義1.3 ROC...
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什么是協(xié)變量Covariate？如何控制隨機(jī)對(duì)照研究中協(xié)變量的影響
初學(xué)者非常迷惑，很多英文SCI經(jīng)常出現(xiàn)Covariate。什么是Covariate？它在統(tǒng)計(jì)分析中扮演什么角色？如何控制它的不良影響呢？ 協(xié)變量是指不同干預(yù)措施前，研究者預(yù)計(jì)...
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三代變異檢測操作說明-DeepVariant
作者：Charon審稿：童蒙編輯：amethyst 眾所周知，三代測序的單堿基測序錯(cuò)誤率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于二代測序，PB的單堿基錯(cuò)誤率有10-15%，而ONT也有5-20%[1]，那么...
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生存分析（Survival analysis）的總結(jié)整理
生存分析(Survival analysis)是指根據(jù)試驗(yàn)或調(diào)查得到的數(shù)據(jù)對(duì)生物或人的生存時(shí)間進(jìn)行分析和推斷，研究生存時(shí)間和結(jié)局與眾多影響因素間關(guān)系及其程度大小的方法，也稱生...
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利用sklearn做ROC曲線注意：畫pr曲線可以參考http://www.cnblogs.com/aquastone/p/random-classifier.html 對(duì)matrix或array型數(shù)據(jù)做...
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16型人格性吸引力大揭秘！
關(guān)注MBTI下午茶，獲取更多有趣的MBTI內(nèi)容。 無論你在網(wǎng)上說自己多么喜歡哪些人格，無論網(wǎng)上的大家在嗑哪些mbti的cp，都是網(wǎng)絡(luò)情緣一線牽！ 但要說性吸引力的話，還是得在...
