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  • 有人這么做過,我之前也這樣做過,但是后來我覺得原始的count矩陣一般不要用,至少要使用log2(count+1)對(duì)他進(jìn)行簡(jiǎn)單的處理。count和fpkm的聚類或者相關(guān)性分析結(jié)果有差異我覺得是因?yàn)閏ount值差距很大,聚類計(jì)算距離的時(shí)候就會(huì)有很大的差別吧。標(biāo)準(zhǔn)化之后就會(huì)小很多。

    重復(fù)之間的相關(guān)性分析

    六一放假?。?!...不可能的。 在實(shí)驗(yàn)時(shí),我們總說到要做重復(fù)。我理解的就是重復(fù)目的是為了消除實(shí)驗(yàn)的技術(shù)因素帶來的誤差。技術(shù)重復(fù)的對(duì)象為同一來源的樣品,生物學(xué)重復(fù)的對(duì)象為不同來...

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    ggplot2超詳細(xì)講解

    一.基本概念 "一張統(tǒng)計(jì)圖形就是從數(shù)據(jù)到幾何對(duì)象(geometric object, 縮寫為geom, 包括點(diǎn)、線、條形等)的圖形屬性(aesthetic attribute...

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