有人這么做過(guò),我之前也這樣做過(guò),但是后來(lái)我覺(jué)得原始的count矩陣一般不要用,至少要使用log2(count+1)對(duì)他進(jìn)行簡(jiǎn)單的處理。count和fpkm的聚類或者相關(guān)性分析結(jié)果有差異我覺(jué)得是因?yàn)閏ount值差距很大,聚類計(jì)算距離的時(shí)候就會(huì)有很大的差別吧。標(biāo)準(zhǔn)化之后就會(huì)小很多。
重復(fù)之間的相關(guān)性分析六一放假?。?!...不可能的。 在實(shí)驗(yàn)時(shí),我們總說(shuō)到要做重復(fù)。我理解的就是重復(fù)目的是為了消除實(shí)驗(yàn)的技術(shù)因素帶來(lái)的誤差。技術(shù)重復(fù)的對(duì)象為同一來(lái)源的樣品,生物學(xué)重復(fù)的對(duì)象為不同來(lái)...