這些關于Linux學習的文章,都是自己在擺弄自己服務器和學習Linux系統(tǒng)時候遇到的一些坑。這里總結(jié)出來,希望可以幫到一些Linux小白。我的服務器上安裝Linux系統(tǒng)是Ce...
第一部分 葉綠體基因組類的文章通常會做重復序列分析,然后通過柱形圖來展示不同長度重復序列的數(shù)量,通過餅圖來展示重復序列位于內(nèi)含子、外顯子和基因間隔區(qū)的比例,以下簡單記錄自己利...
簡介 本課程[https://rockefelleruniversity.github.io/RU_ChIPseq/]介紹 Bioconductor 中的 ChIPseq 分...
0.輸入數(shù)據(jù)和R包 在生信星球公眾號聊天框回復“forest779”即可獲得輸入數(shù)據(jù)。也可以自己根據(jù)表達矩陣與臨床信息生成,如下: 1.多因素cox回歸 建模就一句代碼,出森...
最近有小伙伴問道一個問題,如何在一個單細胞UMAP/TSNE圖上展示多個marker基因的表達,乍一看挺簡單的,后來也是思考了一些時間,慢慢解決了這個問題。 首先,Seura...
最近看一篇文章的時候,發(fā)現(xiàn)文章的作者很厲害,寫了一個用于單細胞轉(zhuǎn)錄組和Bulk RNA的可視化R包---dittoSeq。如果你對於seurat的可視化看膩了,這個R包是一個...
0.起因 最近在群里看到一個圖,棒棒糖圖的點用餅圖代替了。 然后又看到一個文章里,用餅圖代替了富集分析的點圖,妙啊~ 這個地球上有什么漂亮的圖能躲過我的小胖手呢?畫他! 1....
開篇致謝:下面內(nèi)容的整個框架是跟著生信技能樹發(fā)布在bilibili上的ChIP-seq視頻學習的,鏈接:https://www.bilibili.com/video/av29...
參考生信技能樹1以及生信技能樹2只記錄從數(shù)據(jù)下載,到最終結(jié)果展示,具體生物學知識請自行查閱稍后關于ChIP-seq的背景知識我會再發(fā)布一篇文章。數(shù)據(jù)下載:數(shù)據(jù)存放地址關于環(huán)境...