1. 細胞周期背景介紹 細胞周期(cell cycle)是指細胞從一次分裂完成開始到下一次分裂結束所經(jīng)歷的全過程,分為間期與分裂期兩個階段。在細胞周期過程中,細胞的遺傳物質復...
1. 細胞周期背景介紹 細胞周期(cell cycle)是指細胞從一次分裂完成開始到下一次分裂結束所經(jīng)歷的全過程,分為間期與分裂期兩個階段。在細胞周期過程中,細胞的遺傳物質復...
??Seurat作為知名的單細胞數(shù)據(jù)分析框架,雖然很好用,但在大數(shù)據(jù)集一直存在速度上的短板,尤其在FindAllMarkers。所以其一直也在試圖解決,比如通過引入featu...
參考1、后續(xù)分析 https://mp.weixin.qq.com/s/0A9hiXqV1RfWz8UAnratAA[https://mp.weixin.qq.com/s/0...
跟著官網(wǎng)說明學習scater包 introductionscater contains tools to help with the analysis of single-c...
基因表達 什么是基因表達,如下是來自于維基百科的解釋: 研究方法 定量PCR 這部分我不太懂,所以就放幾段百度百科和維基百科的定義。 百度百科 定量PCR(即時聚合酶鏈鎖反應...
傳送門 Shiny基礎教程: 「R shiny 基礎」初識Shiny 「R shiny 基礎」如何進行網(wǎng)頁布局 「R shiny基礎」增加一些小控件 「R shiny基礎」交...
官網(wǎng)教程:Scran1.20.1(最新)[https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/scran/ins...
作者,Evil Genius 最近在看一些文章的時候,發(fā)現(xiàn)在計算細胞豐度差異的時候采用了miloR的方法,今天我們來關注一下。 moilR的原文如下,2022年就發(fā)表了。 與...
本文是參考學習CNS圖表復現(xiàn)16—inferCNV結果解讀及利用[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&mid=...
官方流程:https://satijalab.org/seurat/articles/integration_mapping.html[https://satijalab.o...
infercnv 包的安裝依賴于rjags,rjags包依賴于JAGS庫文件,因此,首先需要安裝JAGS。 windows 安裝 1、下載應用程序 JAGS-4.3.0.ex...
NMF算法簡介 非負矩陣分解(Non-negative Matrix Factorization, NMF)的思想可以描述為,對于任意給定的一個非負矩陣V,NMF算法能夠找到...
單細胞數(shù)據(jù)分析常用到建立trajectory和pseudoTime,擬時序分析可以用 Diffusion( Destiny R package) 給每個細胞添加注釋信息,如這...
關于sva包 sva的用戶說明:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/sva/inst/do...
scATAC分析神器ArchR初探-簡介(1)[http://www.itdecent.cn/p/90ccb3d24322]scATAC分析神器ArchR初探-ArchR進...