Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）...
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KEGG 數(shù)據(jù)庫及API (1) -
RDKit|分子指紋提取、相似性比較及應(yīng)用一、分子指紋提取1.Topological Fingerprints2.MACCS3.Atom Pairs and Topological Torsions4.Morgan ...
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R語言——使用t-SNE算法在R中實現(xiàn)數(shù)據(jù)降維與可視化本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號，轉(zhuǎn)載請注明出處 上期推文我們介紹了一種線性數(shù)據(jù)降維的方法——主成分分析PCA，今天我們再來介紹一種非線性的算法——t-SNE。 t-SNE（t-...
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ggplot2一頁多圖排版的簡便方法更好的閱讀體驗>> 要想在同一頁面上排列多個ggplot2圖形，基本的R函數(shù)par() 和 layout()是無效的。解決方案之一是使用 gridExtra包中的一些函數(shù)來排...
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R語言可視化10: 韋恩圖/upset圖 - VennDiagram/ggVennDiagram/upsetR/ComplexUpset/VennDetail1. 使用包繪制韋恩圖 1.1 兩個數(shù)據(jù)集 1.2 多個數(shù)據(jù)集（此處以5個為示例） 1.3 交集元素的提取 ★ 5個數(shù)據(jù)集是VennDiagram包的上限 2. 使用包繪制韋...
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組間差異檢驗，終于有人講清楚了!什么是組間差異檢驗？就是組間的差異分析以及顯著性檢驗，應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)上的假設(shè)檢驗方法，檢驗組間是否有差異及其差異程度。坦率地講，所有的差異檢驗都基于一個假設(shè)：組間沒有差異，變量之...
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R語言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細(xì)節(jié)作者：白介素2相關(guān)閱讀：R語言ggplot2繪制箱線圖R語言生存分析04-Cox比例風(fēng)險模型診斷R語言生存分析03-Cox比例風(fēng)險模型R語言生存分析-02-ggforestR...
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ggplot2繪制有顯著性標(biāo)注的箱線圖1.箱線圖 盒子內(nèi)反映了半數(shù)的數(shù)據(jù)分布，因此盒子的高度反映了這些數(shù)據(jù)的波動狀態(tài)，盒子越扁表示數(shù)據(jù)分布比較集中； 伸出去的胡須的上下邊緣一般代表了數(shù)據(jù)的最大值和最小值(也可以設(shè)...
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R繪圖_ggsignif添加顯著性標(biāo)識R繪圖做生物學(xué)顯著性統(tǒng)計，然后添加顯著性標(biāo)記，但是都是手動，比較繁瑣，好在ggplot2有個擴(kuò)展包ggsignif，提供更加人性化的方法。 參數(shù)說明：y_position： ...
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[R] 如何快速生成許多差異明顯的顏色？這個需求真的太常見了！注意問題強調(diào)的幾個關(guān)鍵詞：一是快速，二是大量，三是差異明顯。在生成大量元素比較圖時要明顯區(qū)分不同樣本，比如宏基因組中的物種分析： 方法一：自定義 自定義...
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科研小技能（1）：Github 數(shù)學(xué)公式顯示插件前言 github上面有很多學(xué)習(xí)資料比如機器學(xué)習(xí)、統(tǒng)計學(xué)、數(shù)學(xué)、物理等，經(jīng)常涉及到復(fù)雜的數(shù)學(xué)公式，然而它們常常是用markdown 格式編寫的，看起來十分不方便，如果能夠?qū)⑵?..
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ggplot2學(xué)習(xí)筆記之圖形排列R語言基本繪圖函數(shù)中可以利用par()以及l(fā)ayout()來進(jìn)行圖形排列，但是這兩個函數(shù)對于ggplot圖則不太適用，本文主要講解如何對多ggplot圖形多頁面進(jìn)行排列。主要...
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
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2015版macPro13'鍵盤觸摸板失靈故障處理癥狀 開機后，鍵盤除電源按鍵外、全部無法輸入、觸摸板失靈無法使用； 外接usb鍵盤鼠標(biāo)后，外接鍵盤鼠標(biāo)可以正常輸入使用；3.該癥狀間歇性發(fā)生過，好過一陣，失靈一陣；偶爾拍打、...
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pytroch學(xué)習(xí)—生成式對抗網(wǎng)絡(luò)GAN什么是生成式對抗網(wǎng)絡(luò)GAN (本教程的代碼，訓(xùn)練數(shù)據(jù)全部來自—《深度學(xué)習(xí)框架Pytroch入門與實踐》, many thanks,此書采用pytorch 0.4.0版本，AP...
