咸魚精英。
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利用Geneious對(duì)葉綠體基因組進(jìn)行注釋及查看使用軟件：Geneious目的：對(duì)組裝好的葉綠體基因組進(jìn)行注釋，注釋好后進(jìn)行查看，無(wú)誤后繪制圈圖 【注釋部分】 1.首先從NCBI上下載一段與要注釋的物種（目標(biāo)序列）同源的物...
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利用OGDRAW繪制葉綠體圈圖＋Geneious長(zhǎng)度的統(tǒng)計(jì)組裝并注釋完葉綠體基因組后，就要進(jìn)行圈圖的繪制。這里使用在線網(wǎng)站OGDRAW來(lái)繪制圈圖。 主要參考教程：葉綠體基因組注釋、圈圖繪制~ CPGAVAS2，OGDRAW（圖文教程...
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這個(gè)還有第二講第三講么？樓主
昆蟲分類學(xué)講習(xí)班第一講 線粒體基因組淺談
以下是對(duì)宋凡老師（中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)）講座的筆記和個(gè)人總結(jié) 1 線粒體基因組是什么？ 線粒體是重要細(xì)胞器，主要功能是生物供能。 線粒體基因組為雙鏈環(huán)狀DNA，其作為分子標(biāo)記的優(yōu)點(diǎn)包...
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哪里下載呢？
「IGV-GSAme」基因結(jié)構(gòu)注釋信息-人工矯正-神器
IGV-Gene Structure Annotation Manual Editor，簡(jiǎn)稱IGV-GSAme 寫在前面 igv是目前最常用的本地基因組瀏覽器，與其開發(fā)的目標(biāo)...
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GENE模塊---從基因組中提取啟動(dòng)子，UTR序列，引物設(shè)計(jì)及限定引物所產(chǎn)生的區(qū)域從基因組中提取啟動(dòng)子序列，UTR序列往往是費(fèi)時(shí)費(fèi)力的過(guò)程。SPDE的gene模塊是專門為那些從事純粹實(shí)驗(yàn)工作的老師與學(xué)生設(shè)計(jì)。其具體過(guò)程如下： 點(diǎn)擊SPDE的gene模塊（如...
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矯正基因結(jié)構(gòu)注釋 - 做有良心的基因家族分析寫在前面 半個(gè)月前，我推了一個(gè)《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程（原本事實(shí)是開給課題組）。在熱身課程（完全免費(fèi)）中，將我個(gè)人對(duì)基因家族分析的認(rèn)知和其意義均做了說(shuō)明，感...
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具體實(shí)例的分析方法的中文版能再發(fā)一個(gè)文章么？
注釋手工校正工具Apollo-數(shù)據(jù)導(dǎo)入篇
Apollo界面介紹 Apollo的界面（下圖）分為兩個(gè)部分，分別是基因組編輯工作區(qū)(Genomic Editing Workspace)和信息和管理面板(Informati...
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MECAT2: 三代高效組裝工具
MECAT2是三代測(cè)序數(shù)據(jù)PacBio的高效組裝工具，是之前MECAT的改進(jìn)版, 修復(fù)了之前的很多bug, 使用基于string graph的fsa替換了之前的mecat2c...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
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免疫學(xué)碩士一枚～<br>生信熱愛(ài)者但是小白一枚~<br>目前成就為0~<br>加油哦，一大波成就正在路上啦~<br>啾~豬莎要加油哦~
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轉(zhuǎn)錄組分析1——原始數(shù)據(jù)以及過(guò)濾Counts值 對(duì)給定的基因組參考區(qū)域，計(jì)算比對(duì)上的read數(shù)，又稱為raw count（RC）。計(jì)數(shù)結(jié)果的差異的影響因素：落在參考區(qū)域上下限的read是否需要被統(tǒng)計(jì)，按照什...
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轉(zhuǎn)錄組分析2——比對(duì)基因組莎莎寫于2020.5.1學(xué)校第一批返校的同學(xué)已經(jīng)解封了，我還在賓館隔離我今天在這里立個(gè)Flag：每天都要寫簡(jiǎn)書?哈哈哈，可能不太現(xiàn)實(shí)，但是至少今天是新的一個(gè)月的開始要好好學(xué)習(xí)...
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熱圖 | TBtools Heatmap 從入門到精通
寫在前面 2021年，新年第一天，我在忙著家里事情的間隙，分成五次（每次大概30min），錄制了 TBtools 的熱圖（Heatmap）功能的介紹與參數(shù)詳解。 TBtool...
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轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)戰(zhàn)第五節(jié)：EdgeR對(duì)表達(dá)量矩陣進(jìn)行基因表達(dá)差異分析通過(guò)前期的基因定量，我們通過(guò)RSEM或者Kallisto這些工具得到了每個(gè)基因或者轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)量矩陣。輸出的矩陣包含了基因以及在各個(gè)樣本中的表達(dá)量信息，這些信息將為我們后期判...
