有一個(gè)師兄告訴我，bowtie2比對(duì)長度相對(duì)bwa mem是要更長的，所以某種程度上來說bowtie2是比mem更嚴(yán)格一種比對(duì)方法。不知是不是有道理的。
WGS分析筆記（2）—— bwa vs bowtie2更新于2020.10.29 在進(jìn)行正式的mapping記錄之前，先記錄一下bwa與bowtie2在mapping這個(gè)環(huán)節(jié)的情況。 一般對(duì)于WGS結(jié)果的mapping，一般推薦...
請(qǐng)問您有對(duì)注釋后的genbank按序列順序排序嗎？是怎么解決的？謝謝
葉綠體基因組注釋軟件PGA使用說明PGA-Plastid Genome Annotator[https://github.com/quxiaojian/PGA] Qu X-J, Moore MJ, Li D-...
老師好。我使用了該軟件進(jìn)行注釋，但是我發(fā)現(xiàn)注釋獲得的genbank文件中的順序是按照基因名進(jìn)行排序的，而不是按序列進(jìn)行注釋的。
請(qǐng)問有某種工具來排序一下嗎？
葉綠體基因組注釋軟件PGA使用說明PGA-Plastid Genome Annotator[https://github.com/quxiaojian/PGA] Qu X-J, Moore MJ, Li D-...
你好，請(qǐng)問得到的.coord有沒有直接可視化的方法，比如我想做circos圈圖。
應(yīng)該是最新最詳細(xì)的MUMmer中文使用說明如何使用MUMmer比對(duì)大片段序列 測(cè)序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長度，所以一般都是逐個(gè)基因的比較，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方...
最近在看泛基因組學(xué)，學(xué)習(xí)了下MUMMER軟件（http://mummer.sourceforge.net/manual/）：適用于兩個(gè)全基因組（基因草圖or完整基因組）的快速...
正在學(xué)習(xí)這個(gè)，請(qǐng)問你有沒有更詳細(xì)的教程推薦給我呢？謝謝你！
MUMMER 兩個(gè)基因組間比較最近在看泛基因組學(xué)，學(xué)習(xí)了下MUMMER軟件（http://mummer.sourceforge.net/manual/）：適用于兩個(gè)全基因組（基因草圖or完整基因組）的快速...
網(wǎng)速慢的原因找到了 R 與 BioMart 數(shù)據(jù)庫的語言接口 (interface) Durinck S, Spellman P, Birney E, Huber W (20...
說真的，我在大街上遇到老人家摔倒了，沒有監(jiān)控，或者足夠證據(jù)支持我的情況下，我真的不敢去扶人，我受不了被冤枉，還要被網(wǎng)絡(luò)暴力的傷害。
永遠(yuǎn)不知道感恩和冤枉誰先來。
北京朝陽這起車禍，讓我看到人性最大的惡1. 先說一起駭人聽聞的事故。 7月16日3時(shí)，北京朝陽區(qū)，一輛路虎越野車，追尾了一輛鏟車。 越野車冒起滾滾白煙，有燃燒的跡象。 由于越野車卡在鏟車下面，車身損壞，越野車車門...
每個(gè)女人懷孕的時(shí)候，無論平時(shí)看著多么強(qiáng)悍，內(nèi)心多么狂野，再有了寶寶之后，都會(huì)存有一絲柔情，隨著胎兒的長大，女性的身體也會(huì)隨著變化，身體發(fā)胖、胸部發(fā)育，骨盆變寬等等。 十月懷胎...
最近正好在學(xué)習(xí)這幾個(gè)方面，收藏了。
基因家族分析全套軟件基因家族生物信息學(xué)分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過基因復(fù)制進(jìn)行物種特異性擴(kuò)增，主要有染色體片段復(fù)制、串聯(lián)復(fù)制和反轉(zhuǎn)錄子轉(zhuǎn)座等三種形式，可能導(dǎo)致功能丟...
@Navi丶S1mple 感謝！我在2.7下進(jìn)行，順利運(yùn)行了，非常感謝。因?yàn)槲沂鞘褂美蠋熃o的指導(dǎo)文件，可能有些內(nèi)容過時(shí)了。再次感謝！
其實(shí)MCScan畫圖也可以很好看最近發(fā)現(xiàn)了python版的MCScan，是個(gè)大寶藏。由于走了不少彎路，終于畫出美圖，趕緊記錄下來 github地址 https://github.com/tanghaibao...
