hello，今天我們繼續(xù)來分享分析代碼部分，這一次，我們直接用單細胞Seurat 的分析結果聯合VDJ進行分析，話不多說，直接開始。 寫出h5ad 開始分析,數據大家換成自己...
IP屬地：廣東
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10X單細胞（10X空間轉錄組）轉錄組 & VDJ 聯合分析（14）之CoNGA -
單細胞數據處理小細節(jié)匯總1. Seurat對象查看當前的Assay 在進行了SCTransform操作后，矩陣默認會變成SCT矩陣，如果不加設置，后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣。修改Defau...
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一顆菜墩
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“我不想24歲了，還花家里的錢”
今天接到一個小姑娘的咨詢，她問我的公眾號有沒有兼職可以提供，她可以做一些簡單的下游分析賺點外快。 我說沒有呀。 科研服務是個苦差事 其實倒是經常有一些讀者來求助，想要找我們做...
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一只末流985生物
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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時空軌跡分析導論作者，追風少年i 時間很快，轉眼就周四了，怎能因昨天的苦難而選擇停留。 今天我們來分享一下關于空間轉錄組的軌跡分析問題。 在最開始，空間轉錄組分析還不是那么成熟的時候，對空間...
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生信堿移小編
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超全總結--單細胞+空間轉錄組的整合分析方法總結這一篇我們做一個詳細的總結，周五了，疫情還沒結束，父母也都老了，有時候真的感覺身為兒子實在不孝，常年在外，回家很少，家里有點事父母也不會跟我這個兒子說，小病小災的也舍不得去醫(yī)...
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單細胞之軌跡分析-6：velocyto.R+Seurat軌跡分析系列： 單細胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 單細胞之軌跡分析-2：mono...
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We'll do whatever just to stay alive.
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學習
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單細胞測序CNS文章圖表復現
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包含單細胞、空間的文獻思路
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這個世界流行離開，但我們卻不擅長告別
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【代碼更新】單細胞分析實錄(20): 將多個樣本的CNV定位到染色體臂，并畫熱圖
之前寫過三篇和CNV相關的帖子，如果你做腫瘤單細胞轉錄組，大概率看過： 單細胞分析實錄(11): inferCNV的基本用法[http://www.itdecent.cn/...
