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  • 洲更,你的博客刷新太慢了,影響體驗(yàn)。有沒有什么辦法提高一下?

    「基因組組裝」三代組裝多少深度比較合適

    一句話總結(jié),組裝深度建議高于30X,N50建議高于11Kb,否則會出現(xiàn)嚴(yán)重的片段化。 最初參加三代組裝培訓(xùn)的時候,課程老師建議Canu使用所有數(shù)據(jù)進(jìn)行組裝會比較好。因?yàn)槲医M裝...

  • liftOver進(jìn)行不同版本染色體位置轉(zhuǎn)換

    人類基因組計(jì)劃啟動20年,目前出了很多基因組版本2013年的GRCh38/hg38 (最新)2009年的GRCh37/hg19 (常用)2006年的GRCh36/hg18...

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    SRA 數(shù)據(jù)下載自救指南

    還在羨慕海峽那邊的朋友下載SRA 快到飛起?還在難過用wget 下載數(shù)據(jù)經(jīng)常下載不完整?用了官方的下載工具還是慢的不行?這里有一個SRA 下載自救嘗試指南供你參考。 需要用到...

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    無參轉(zhuǎn)錄組序列組裝 — Trinity

    轉(zhuǎn)錄組分析策略 轉(zhuǎn)錄組分析策略根據(jù)有無參考轉(zhuǎn)錄組可以分為兩類: 有參比對—定量—差異分析—功能富集分析等 無參組裝—定量—差異分析—功能富集分析等image 無參考轉(zhuǎn)錄組序列...

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    smart-seq2 實(shí)踐

    單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組:smart-seq2 參考資料: Smart-seq2 scRNA小鼠發(fā)育學(xué)習(xí)筆記: http://www.itdecent.cn/p/23a8fcb1292...

  • 2020-05-02

    awk實(shí)現(xiàn)兩個文件的合并文件A:12 ab we h的34 bf dwd d豐富56 dejw csc 而從容文件B:12 ddd de 得分34 ede ee...

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    關(guān)于unique mapped reads

    如下圖,是tophat2比對完之后的結(jié)果 1、bowtie2XS:i: Alignment score for the best-scoring alignment fou...

  • 如何獲取sam文件中序列比對到哪條鏈,F(xiàn)LAG信息解讀

    轉(zhuǎn)載自嘻皮悠的博客 http://blog.sina.com.cn/u/2054060511————————————————————————————————————————...

  • 這是在哪里呀

    不負(fù)春光不負(fù)卿

    難得有心情看看朋友圈,刷屏的油菜花美圖,已經(jīng)是兩天前的日期,心里才想起我也該好好看看那片花海了。不然一不留神就錯過了花期,看了,也算是將短短的油菜花期在記憶里延長一些吧。 所...

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    不負(fù)春光不負(fù)卿

    難得有心情看看朋友圈,刷屏的油菜花美圖,已經(jīng)是兩天前的日期,心里才想起我也該好好看看那片花海了。不然一不留神就錯過了花期,看了,也算是將短短的油菜花期在記憶里延長一些吧。 所...

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    fragement/reads, insert size/fragement size 的區(qū)別

    fragement是reads 比對參考序列時,得知與其pair的另一條reads是否也比對上這個位置,這兩條互相配對的reads就是fragement。insert siz...

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    學(xué)習(xí)筆記

    2019.10.1添加環(huán)境變量:永久式:1.echo $PATH 3. source ~/.bashrc #source 命令使該文件立即生效;如果不source,需要在下...

  • 不行啊

    CCProxy8.0詳細(xì)安裝破解教程(附序列號生成器,全網(wǎng)獨(dú)家可用)

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    RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實(shí)戰(zhàn)練習(xí)

    前言 這次給大家?guī)淼氖?6年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章:Transcript-level expression analy...

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