一、 簡述 ? ? 為了從基因的表達水平中得到更加具體直觀的生物學功能變化的信息，多種基于已知的基因集的分析方法應運而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
-
GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它們的聯(lián)系與區(qū)別 -
-
【R畫圖學習13.4】散點圖---單細胞不同亞群火山圖下面這個圖是我在單細胞相關文章中見過的，也算是火山圖的變種。可以看出X軸是不同的細胞類型，Y軸是marker基因的fold change（log2）,但是不同類別之間他們是不...
-
R語言Cibersort文件獲取+代碼在R語言中運行Cibersort共需要三個文件，分別是（1）官方提供的22種細胞基因集“LM22.txt”；（2）自己的表達矩陣；（3）Cibersort代碼。 （1）LM2...
-
cibersort報錯解決
殺殺 使用cibersort報錯了，提示warning，還有cibersort Error in h(simpleError(msg, call)): 在為'sort'函數(shù)選...
-
【文獻解析】替莫唑胺誘導的超突變與IDH突變低級別膠質(zhì)瘤的遠期復發(fā)與生存率降低相關《Temozolomide-induced hypermutation is associated with distant recurrence and reduced s...
-
膠質(zhì)瘤化療臨床實驗簡介匯總
殺殺 匯總膠質(zhì)瘤化療藥相關的II-III期臨床實驗以及大致簡介 Temozolomide（TMZ A randomized phase III Intergroup stud...
-
-
R語言多因素cox回歸構(gòu)建預測模型殺殺 （第一步不作贅述，一般會使用單因素cox或者尋找差異基因等方法，篩選與生存相關的分子，準備進行下一步的模型構(gòu)建） 本篇舉例是篩選了12個單因素cox與生存顯著相關的分子...
-
-
R語言KEGG通路信息下不下來怎么辦
殺殺報錯信息：Error in download.KEGG.Path(species): 'species' should be one of organisms l 再運行...
-
服務器Jupyter Notebook和Samba的安裝及部署——by不是殺殺Samba是在Linux和UNIX系統(tǒng)上實現(xiàn)SMB協(xié)議的一個免費軟件，由服務器及客戶端程序構(gòu)成（來自百度百科），簡單來說它可以實現(xiàn)服務器端（Linux）與Wi...
-
R語言cox森林圖繪制殺殺 cox 森林圖繪制 cox的結(jié)果多為數(shù)據(jù)，繪制成表格較為不便，因此可以用森林圖進行美化展示 R語言中森林圖的實現(xiàn)代碼較為簡單： 最終繪制圖形
-
謝謝提醒，迭代比較確實應該是矩陣的最后一行，已更正文章
R語言實現(xiàn)動態(tài)規(guī)劃
殺殺 在生信中，動態(tài)規(guī)劃的原理是實現(xiàn)序列比對算法的基礎原理之一 經(jīng)典案例之一就是小偷問題：假如一個小偷需要偷竊連續(xù)的十家人，每個屋子里能夠偷竊的錢數(shù)不同，但是小偷不能連續(xù)進入...
-
不會生信喲 ·請問最后輸入結(jié)果return(max(data[length(nums)-1,1],data[length(nums)-1,2])),其中max的比較為什么是在length(nums)-1行，而不是length(nums)行呢？
-
R語言拼圖（含生存分析），R語言畫布設置
殺殺 發(fā)一些拼圖的小技巧 拼圖之前，先要根據(jù)自己圖片的張數(shù)，設置好畫布大小，這很重要我畫圖的經(jīng)驗中，正常一張方形的圖會設置為width和height都等于5，如果兩張橫著拼在...
-
R語言拼圖（含生存分析），R語言畫布設置殺殺 發(fā)一些拼圖的小技巧 拼圖之前，先要根據(jù)自己圖片的張數(shù)，設置好畫布大小，這很重要我畫圖的經(jīng)驗中，正常一張方形的圖會設置為width和height都等于5，如果兩張橫著拼在...
-
KEGG通路數(shù)據(jù)庫下載(人種)
方法一在MSigDB下載，網(wǎng)址GSEA | MSigDB | MSigDB Collections。下載到 gmt 格式文件使用 GSEABase 包的 getGmt 函數(shù)讀...
