你好，請問可以分享一下這個~/hychao/script/format_mergeFA.py么？感謝感謝！??
單拷貝直系同源基因構(gòu)建物種進化樹最近用Orthofinder做物種進化樹，最后出來的物種樹的結(jié)構(gòu)跟已發(fā)表研究的結(jié)果差距較大，在我的印象里Orthofinder軟件是用單拷貝直系同源基因進行建樹的，然后跟老師...
IP屬地：湖北
-
-
單拷貝直系同源基因構(gòu)建物種進化樹最近用Orthofinder做物種進化樹，最后出來的物種樹的結(jié)構(gòu)跟已發(fā)表研究的結(jié)果差距較大，在我的印象里Orthofinder軟件是用單拷貝直系同源基因進行建樹的，然后跟老師...
-
日常搬磚
-
請問juicerbox調(diào)整時候，右下角的沒有掛載到染色體上的一些contig或者說scaffold這些需要刪除么，move to debris選項沒有變化，它們應(yīng)該已經(jīng)是debris了。我試過去除掉染色體邊界，但是去不掉，只能都選中再去掉染色體邊界，這些會變成一個染色體。
De novo組裝#07 | 染色體掛載 （allhic，3d-dna）
寫在前面 初始組裝經(jīng)過基因組糾錯（polish）以及去冗余（purge）之后，就可以將其掛載到染色體上，使其由contig/scaffold級別的基因組提升到chromoso...
-
科服：生信、AI、育種。全網(wǎng)同號
-
請問腳本中的up和down變量指HSP的上下游的延伸長度么，這個長度一般根據(jù)什么信息指定呢？
基因家族：用python處理blast結(jié)果區(qū)域延伸的問題
tblastn比對出來候選HSP區(qū)段，我們需要根據(jù)一定的基因長度范圍來進行區(qū)域延伸去重疊，然后進行exonerate或者genewise建模。對HSP區(qū)域的延伸要考率基因的長...
