使用homer判斷A/B compartment 也需要根據(jù)TSS文件手動(dòng)矯正嗎?我看homer軟件也會(huì)考慮TSS啊
AB區(qū)室計(jì)算【juicer/homer】Tips: 目前主流的計(jì)算AB區(qū)室工具: juicer/homer/cworld juicer: 第一篇HiC文章實(shí)驗(yàn)室提供的工具,計(jì)算多個(gè)分辨率每個(gè)bin的PC1 值,但是...
多換幾個(gè)鏡像試試
day43 失?。篶onda卡頓無(wú)法install 怎么辦使用學(xué)校服務(wù)器安裝軟件失敗為什么會(huì)卡頓?明明昨天上午還能用conda install安裝,下午在安裝htseq的時(shí)候,突然就不能用了。conda install htseq之...
本節(jié)來(lái)介紹一個(gè)ggplot2的擴(kuò)展包gggenomes使用它可以輕松地對(duì)不同來(lái)源的基因數(shù)據(jù)組合成一個(gè)全面而優(yōu)雅的圖,下面讓我們來(lái)看一個(gè)小例子 安裝R包 目前gggenomes...
寫的非常棒!iced需要通過(guò)pypi
手動(dòng)安裝
HiC-Pro的安裝要使用HiC數(shù)據(jù)就會(huì)不可避免的要使用到HiC-Pro,但是HiC-Pro是一個(gè)比較難纏的軟件,需要安裝的東西比較多,會(huì)影響的東西比較多,因此我們使用conda建立一個(gè)新環(huán)境來(lái)...
要使用HiC數(shù)據(jù)就會(huì)不可避免的要使用到HiC-Pro,但是HiC-Pro是一個(gè)比較難纏的軟件,需要安裝的東西比較多,會(huì)影響的東西比較多,因此我們使用conda建立一個(gè)新環(huán)境來(lái)...
謝謝,學(xué)習(xí)一下,最近的PPT匯報(bào)總被批評(píng)
如何在開(kāi)題、中期和答辯的PPT匯報(bào)中理清思路獲得老師好評(píng)?前面推文提到過(guò)我的研究課題并不是十分好,基于此只能就現(xiàn)有的材料了解透徹并盡量做好。開(kāi)題匯報(bào)夸獎(jiǎng)PPT講得好,中期匯報(bào)拿到了前幾的分?jǐn)?shù),預(yù)答辯得到校外專家的認(rèn)可。無(wú)論是開(kāi)題,中...
Cool!非常有用,建議多多更新
ATAC-seq差異peaks火山圖繪制差異peaks分析是ATAC-seq下游分析中非常重要的一步,可以鑒定出不同樣本之間開(kāi)放程度不同的DARs(Different Accessible Regions),...
差異peaks分析是ATAC-seq下游分析中非常重要的一步,可以鑒定出不同樣本之間開(kāi)放程度不同的DARs(Different Accessible Regions),...