喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
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你好，我出現(xiàn)了報(bào)錯(cuò):
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找了好久找不到原因，基本數(shù)據(jù)是按照你的形式改的。能幫我看看嗎【R】批量T檢驗(yàn)
注意事項(xiàng) 本代碼適用于Student T檢驗(yàn)，別的統(tǒng)計(jì)方法需要改代碼 本代碼中默認(rèn)數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布且方差齊，如果數(shù)據(jù)對(duì)這兩項(xiàng)敏感，則需要提前檢驗(yàn) 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 將數(shù)據(jù)按下表的形式...
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R語(yǔ)言 畫生存曲線圖做生存分析菜鳥終于做到生存分析了。 首先準(zhǔn)備好你的數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)最重要的兩大要點(diǎn)：1要有生存時(shí)間time2要有事件的狀態(tài) 截尾or死亡 看一下我準(zhǔn)備的數(shù)據(jù) head(d)ID time s...
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再請(qǐng)問(wèn)一下，我只有兩個(gè)樣本，一個(gè)樣本是對(duì)照組，一個(gè)樣本是實(shí)驗(yàn)組，做Limma分析做不了，該用什么包？
GSVA + limma進(jìn)行差異通路分析
一般我們做GSEA都是先進(jìn)行差異基因分析，然后取差異倍數(shù)排序結(jié)果進(jìn)行GSEA。但如果你沒(méi)有條件進(jìn)行差異基因分析也可以進(jìn)行GSEA，這就是ssGSEA(single sampl...
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請(qǐng)問(wèn)一下， keggSet這里面的內(nèi)容是什么。我是測(cè)序的數(shù)據(jù)，只有基因的entrizid編號(hào)，怎么獲得？
GSVA + limma進(jìn)行差異通路分析
一般我們做GSEA都是先進(jìn)行差異基因分析，然后取差異倍數(shù)排序結(jié)果進(jìn)行GSEA。但如果你沒(méi)有條件進(jìn)行差異基因分析也可以進(jìn)行GSEA，這就是ssGSEA(single sampl...
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用生物信息解決生物學(xué)問(wèn)題
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繪制差異基因kegg注釋圖
“差異基因kegg注釋圖”是轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的重要組成部分，能夠幫助大家了解差異基因分屬于哪些代謝通路，文章中如果能夠插入下面這類圖來(lái)說(shuō)明樣品間的差異，一定會(huì)為你的文章增色不少...
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R語(yǔ)言-GO富集分析的超幾何檢驗(yàn)和可視化Gene Ontology 可分為分子功能（Molecular Function），生物過(guò)程（biological process）和細(xì)胞組成（cellular compon...
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R包-KEGG的超幾何檢驗(yàn)和基因富集分析（菜鳥篇）什么是基因富集分析？ 基因富集分析(gene set enrichment analysis)是在一組基因或蛋白中找到一類過(guò)表達(dá)的基因或蛋白。一般是高通量實(shí)驗(yàn)，如基因芯片，R...
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